藤山宗，伊藤夕樹，長野浩一，樽屋啓之，中田達，伊藤祐二，籾井和朗 .  評価板を用いたコンクリート開水路の粗度係数の推定 .  農業農村工学会論文集305   97 - 102   2017年12月査読

藤山宗，樽屋啓之，中田達，浪平篤，伊藤祐二，籾井和朗，酒井一人 .  農業用水路における漸縮係数に関する実験的研究 .  土木学会論文集B1(水工学)72 ( 4 ) 547 - 552   2016年5月査読

藤山宗，樽屋啓之，中田達，嶺田拓也，伊藤祐二，籾井和朗 .  パッチ状の水路補修が開水路の通水性に関する水理機能に及ぼす影響評価 .  農業農村工学会論文集   2015年6月査読

Ito, Y., Momii, K. .  Impacts of regional warming on long-term hypolimnetic anoxia and dissolved oxygen concentration in a deep lake .  Hydrological Processes   2015年4月査読

Eguchi, T., Ito, Y., Yoshida, S. .  Instantaneous Flooding and α-Tocopherol Content in Tuberous Roots of Sweetpotato (Ipomoea batatas (L.) Lam.) .  Environmental Control in Biology53 ( 1 ) 13 - 16   2015年3月査読

伊藤祐二 .  私のビジョン・研究の新たなスタート地点に立って .  農業農村工学会誌82 ( 5 ) 58 - 60   2014年5月

Yoshino, K., Katano, T., Ito, Y., Hamada, T., Fujii, N., Hayami, Y. .  Community assembly by recruitment limitation in a hypoxia-stressed soft bottom: A case study of macrobenthos in Ariake Bay .  Plankton and Benthos Research9 ( 1 ) 57 - 66   2014年3月査読

片野俊也，吉野健児，伊藤祐二，速水祐一 .  有明海奥部におけるシャットネラの発芽シスト数と赤潮との関連 .  プランクトン学会報61 ( 1 ) 8 - 14   2014年2月査読

髙木 東，籾井和朗，肥山浩樹，伊藤祐二 .  南九州畑地集水域における降雨流出特性― 鹿児島県大隅および徳之島地域の事例 ― .  農業農村工学会論文集288   113 - 120   2013年12月査読

郡山益実，荒木啓輔，伊藤祐二，片野俊也，石谷哲寛 .  有明海奥部底質における吸着態NH4+の季節変化とその影響因子 .  土木学会論文集B2（海岸工学）69 ( 2 ) 1141 - 1145   2013年11月査読

片野俊也，吉野建児，伊藤祐二，速水祐一 .  有明海奥部の植物プランクトンの季節変化：特に夏季，冬季の有害赤潮と環境要因の関連について .  沿岸海洋研究51 ( 1 ) 53 - 64   2013年8月査読

Ito Y., Katano T., Fujii N., Koriyama M., Yoshino K., Hayami Y. .  Decreases in turbidity during neap tides initiate late winter blooms of Eucampia zodiacus in a macrotidal embayment .  Journal of Oceanography69 ( 4 ) 467 - 479   2013年8月査読

手塚公裕，伊藤祐二，片野俊也，加瑞，日野剛徳，速水祐一，大串浩一郎 .  諫早湾調整池への海水導入を想定した実験による底質からのアンモニウム態窒素溶出量の見積もり .  水環境学会誌36 ( 2 ) 49 - 56   2013年3月査読

郡山益実，荒木啓輔，伊藤祐二，片野俊也，石谷哲寛 .  有明海奥部底泥における栄養塩フラックスの季節変化 .  土木学会論文集B2（海岸工学）68 ( 2 ) 1056 - 1060   2012年11月査読

伊藤祐二 .  学会賞を受賞して .  農業農村工学会誌80 ( 11 ) 65 - 65   2012年11月

Eguchi T., Ito Y., Yoshida S. .  Periodical wetting increases α-tocopherol content in the tuberous roots of Sweetpotato (Ipomoea batatas (L.) Lam.) .  Environmental Control in Biology50 ( 3 ) 297 - 303   2012年9月査読

手塚公裕，片野俊也，濱田孝治，加瑞，日野剛徳，速水祐一，伊藤祐二，大串浩一郎 .  諫早湾および隣接する調整池における底質の栄養塩分布 .  海の研究21 ( 3 ) 69 - 81   2012年5月査読

伊藤祐二，郡山益実，宮本英揮，瀬口昌洋，筑紫二郎 .  周期的変動波の平均水位計測に対するTDRの適用 .  農業農村工学会論文集277   65 - 72   2012年2月査読

伊藤祐二，速水祐一，片野俊也，郡山益実 .  海象観測タワーデータに基づく筑後川エスチュアリー下部の海洋構造の季節・大潮小潮周期変化 .  海の研究21 ( 1 ) 1 - 16   2012年1月査読

伊藤祐二，郡山益実，宮本英揮，梅谷知弘，筑紫二郎 .  マイクロ波を利用した淡水の水位・電気伝導度および淡塩水境界位の計測システム .  水文・水資源学会誌24 ( 3 ) 170 - 176   2011年5月査読

伊藤祐二，籾井和朗 .  気象変化が深い湖の湖面蒸発量，水温，熱収支に及ぼす影響 ―鹿児島県池田湖の事例― .  農業農村工学会論文集269   93 - 103   2010年10月査読

Ito Y., Chikushi J., Miyamoto H. .  Multi-TDR probe designed for measuring soil moisture distribution near the soil surface .  Proceedings of 19th World Congress of Soil Science   117 - 120   2010年8月査読

伊藤祐二，宮本英揮，郡山益実，筑紫二郎，瀬口昌洋 .  マイクロ波のエネルギー吸収特性を利用した淡塩水境界面の計測 .  土木学会論文集B66 ( 2 ) 189 - 195   2010年5月査読

伊藤祐二，宮本英揮，安永円理子，江口壽彦，筑紫二郎 .  生物環境調学分野におけるECH2Oプローブの適用事例 .  土壌の物理性114   33 - 36   2010年3月査読

伊藤祐二，宮本英揮，筑紫二郎 .  時間領域反射法による水中の堆積土砂表面位および電気伝導度の同時計測 .  農業農村工学会論文集263   81 - 90   2009年10月査読

伊藤祐二，宮本英揮，筑紫二郎 .  時間領域反射法による水中堆積土砂表面位の評価法 .  農業農村工学会論文集262   75 - 81   2009年8月査読

宮本英揮，長 裕幸，伊藤祐二，筑紫二郎，江口壽彦 .  種々の電気伝導度条件に対する静電容量式土壌水分センサーの校正モデル .  植物環境工学21 ( 2 ) 86 - 91   2009年6月査読

宮本英揮，吉田 敏，筑紫二郎，江口壽彦，伊藤祐二 .  水分移動特性に基づく有機・無機培地内水分環境の評価 .  植物環境工学21 ( 2 ) 72 - 78   2009年6月査読

伊藤祐二，筑紫二郎，宮本英揮 .  TDRによる表層土壌水分計の開発とその有効性の評価 .  土壌の物理性111   35 - 41   2009年3月査読

Ito Y., Momii K., Nakagawa K. .  Modeling the water budget in a deep caldera lake and its hydrologic assessment: Lake Ikeda, Japan .  Agricultural Water Management96   35 - 42   2009年1月査読

Momii K., Ito Y. .  Heat budget estimates for Lake Ikeda, Japan .  Journal of Hydrology361   362 - 370   2008年8月査読

伊藤祐二，籾井和朗，吉満由佳，面髙みさき，中川 啓，竹内真一 .  Bowen比法による畑地の蒸発散量の推定に関する考察 .  鹿児島大学農学部学術報告58   22 - 28   2008年3月

伊藤祐二，籾井和朗 .  池田湖の1981年から2005年の熱収支解析 .  応用水文20   1 - 10   2007年12月査読

Ito Y., Momii K., Nakagawa K. .  Impact of agricultural water management on lake water budget: A case study of Lake Ikeda, Japan .  IAHS Publication315   179 - 185   2007年7月査読

伊藤祐二，籾井和朗，小林 隼 .  現地観測に基づく鹿児島市の地下水に関する考察 .  鹿児島大学農学部学術報告57   13 - 20   2007年3月

伊藤祐二，籾井和朗 .  現地観測に基づく池田湖の熱収支 .  農業土木学会論文集247   103 - 111   2007年2月査読

伊藤祐二，籾井和朗，中川 啓，髙木 東 .  池田湖水位の推定モデル －水資源としての湖の水収支に関する研究－ .  農業土木学会論文集243   65 - 72   2006年6月査読

伊藤祐二 .  水収支解析による池田湖水位の推定－水資源としての湖の水収支に関する研究－ .  平成17年度農業土木学会九州支部シンポジウム   1 - 8   2005年10月

籾井和朗，長 勝史，伊藤祐二 .  池田湖の放射量の推定 .  鹿児島大学農学部学術報告52   1 - 8   2002年3月

Momii K., Cho K., Ito Y. .  Hydrologic and Thermal Environment of Lake Ikeda .  Proceedings of 9th International Conference on the Conservation and Management of Lakes   88 - 91   2001年11月

伊藤祐二，安藤潤，村田龍星，宇野賢志，籾井和朗 .  湖面蒸発量に及ぼす気象要素の潜在的影響力と時間変動の影響 .  平成29年度 水文・水資源学会 

藤山宗，伊藤祐二，籾井和朗，中田達，樽屋啓之 .  評価板を用いたコンクリート開水路の粗度係数の推定 .  平成29年度 農業農村工学会 

藤山宗，樽屋啓之，中田達，浪平篤，伊藤祐二，籾井和朗，酒井一人 .  農業用水路における漸縮係数に関する実験的研究 .  平成27年度(第60回) 水工学講演会@仙台 

村田龍星，伊藤祐二，籾井和朗 .  湖の熱環境に影響を及ぼす地域的環境要因 .  平成27年度 農業農村工学会九州沖縄支部講演会@那覇 

松本薫，平島雄太，伊藤祐二，宮本英揮 .  サーモモジュールを利用した実蒸発散量の推定 .  平成27年度 土壌物理学会@佐賀 

Ito, Y., Ando, J., Momii, K. .  Thermal responses to regional changes in climate and water clarity in Lake Ikeda, Japan .  HydroEco2015@Vienna, Austria  国際会議

森一晃，籾井和朗，伊藤祐二 .  地下水中の分散係数の推定に関する実験的研究 .  平成26年度 農業農村工学会九州支部講演会  平成26年度 農業農村工学会九州支部講演会

片野俊也，吉野健児，伊藤祐二，速水祐一 .  Chattonella marinaとAkashiwo sanguineaは競合していないのか？ .  平成26年度 日本プランクトン学会・ベントス学会合同大会  平成26年度 日本プランクトン学会・ベントス学会合同大会

片野俊也，吉野健児，伊藤祐二，濱田孝治，速水祐一 .  有明海奥部と諫早湾の水質および植物プランクトンの比較 .  平成26年度 日本海洋学会(秋季大会)  平成26年度 日本海洋学会(秋季大会)

伊藤祐二，織田翔平，籾井和朗 .  池田湖の温暖化と熱特性の変化 .  平成26年度 水文・水資源学会  平成26年度 水文・水資源学会

伊藤祐二，石橋恭平，籾井和朗 .  砂とクロボクの土壌水分計測に対するTDT・TDR・静電容量法の有効性の比較 .  平成26年度 農業農村工学会  平成26年度 農業農村工学会

伊藤祐二，籾井和朗，大久保道徳 .  池田湖の全循環発生と溶存酸素の季節変化 .  平成25年度 農業農村工学会九州支部講演会  平成25年度 農業農村工学会九州支部講演会

伊藤祐二，籾井和朗 .  池田湖における長期モニタリングと湖水環境の変化 .  平成25年度 日本陸水学会  平成25年度 日本陸水学会

伊藤祐二，籾井和朗 .  地域温暖化が池田湖深層の21年間の無酸素化に及ぼす影響 .  平成25年度 農業農村工学会  平成25年度 農業農村工学会

江口壽彦，伊藤祐二，吉田敏 .  短時間の冠水処理の時期および回数がサツマイモ塊根の抗酸化物質含量に及ぼす影響 .  平成25年度 日本生物環境工学会  平成25年度 日本生物環境工学会

Yoshino K., Katano T., Ito Y., Fujii N., Hamada T., Hayami Y. .  Benthic community organization in the inner part of Ariake Bay (Japan) .  The First Asian Marine Biology Symposium  The First Asian Marine Biology Symposium国際会議

吉野健児，片野俊也，伊藤祐二，濱田孝治，藤井直紀，速水祐一 .  有明海湾奥部ベントス群集の季節変動パターンと形成要因 .  平成24年度 プランクトン・ベントス学会  平成24年度 プランクトン・ベントス学会

藤井直紀，伊藤祐二，吉野健児，片野俊也，速水祐一 .  有明海奥部表層におけるビゼンクラゲ出現傾向 .  平成24年度 日本海洋学会（秋季大会）  平成24年度 日本海洋学会（秋季大会）

伊藤祐二，片野俊也，藤井直紀，吉野健児，速水祐一 .  有害珪藻Eucampia zodiacusのブルーム発達過程 .  平成24年度 日本海洋学会（秋季大会）  平成24年度 日本海洋学会（秋季大会）

Momii, K., Ito, Y. .  Influence of regional warming trends on lake water dissolved oxygen dynamics -A preliminary investigation in Lake Ikeda, Japan .  Nordic Water 2012, XXVII Nordic Hydrological Conference  Nordic Water 2012, XXVII Nordic Hydrological Conference国際会議

伊藤祐二，片野俊也，速水祐一，藤井直紀 .  海象観測タワーにおける筑後川河口沖の溶存酸素濃度のモニタリング .  平成24年度 日本海洋学会（春季大会）  平成24年度 日本海洋学会（春季大会）

片野俊也，伊藤祐二，藤井直紀，速水祐一 .  有明海観測タワーによる赤潮のモニタリング .  平成24年度 日本海洋学会（春季大会）  平成24年度 日本海洋学会（春季大会）

藤井直紀，伊藤祐二，片野俊也，速水祐一 .  インターバルカメラによる有明海表層生物モニタリングの試み .  平成24年度 日本海洋学会（春季大会）  平成24年度 日本海洋学会（春季大会）

手塚公裕，片野俊也，伊藤祐二，加瑞，日野剛徳，速水祐一，大串浩一郎 .  諫早湾調整池への海水導入に伴う底質からのNH4-N溶出 .  平成24年度 日本海洋学会（春季大会）  平成24年度 日本海洋学会（春季大会）

Katano T., Yoshida M., Yoshino K., Yamaguchi S., Ito Y., Hayami Y. .  Bloom development of Chattonella (raphidophyceae) with reference to the nutrient source in the Ariake Sea, Japan .  The 5th IMBER C-J-K Symposium  The 5th IMBER C-J-K Symposium国際会議

Ito Y., Yasuda H., Nakagawa K., Kawai T., Chikushi J. .  Time domain reflectometry application to measurements of groundwater level and freshwater/saltwater interface level in sandy layer .  ASA・CSSA・SSSA International Annual Meetings  ASA・CSSA・SSSA International Annual Meetings国際会議

江口壽彦，伊藤祐二，吉田敏 .  灌水法の違いがサツマイモ塊根に及ぼす影響 .  H23年度 日本生物環境工学会  H23年度 日本生物環境工学会

手塚公裕，片野俊也，濱田孝治，加瑞，日野剛徳，速水祐一，伊藤祐二，大串浩一郎 .  諫早湾および隣接する調整池における底質の平面分布 .  平成23年度 日本海洋学会（秋季大会）  平成23年度 日本海洋学会（秋季大会）

郡山益実，荒木啓輔，伊藤祐二，石谷哲寛，岩本優佳 .  有明海奥部における低泥-海水間の無機態窒素 .  平成23年度 農業農村工学会  平成23年度 農業農村工学会

伊藤祐二，郡山益実，宮本英揮，筑紫二郎 .  淡塩水境界位計測のための同軸型TDRプローブの開発 .  平成23年度 農業農村工学会  平成23年度 農業農村工学会

伊藤祐二，籾井和朗 .  鉛直1次元モデルに基づいた池田湖における水温の変化傾向の解析 .  平成23年度 水文・水資源学会  平成23年度 水文・水資源学会

手塚公裕，片野俊也，濱田孝治，加瑞，日野剛徳，速水祐一，伊藤祐二，大串浩一郎 .  諫早湾と調整池における底質の平面分布特性 .  平成23年度 土木学会  平成23年度 土木学会

伊藤祐二，速水祐一，郡山益実 .  海象観測タワーデータに基づく筑後川エスチャリーの海洋構造の季節変化 .  平成23年度 日本海洋学会（春季大会）  平成23年度 日本海洋学会（春季大会）

Yoshino K., Katano T., Hamada T., Ito Y., Hayami Y. .  Hypoxic impacts on the benthic community in Ariake Bay .  ASLO, Aquatic Science Meeting  ASLO, Aquatic Science Meeting国際会議

伊藤祐二，籾井和朗，東井上宗太，西川薫 .  気候変化が地域水資源としての湖の水質に及ぼす影響 ―池田湖の水温及び溶存酸素に関する考察― .  平成22年度 農業農村工学会九州支部講演会  平成22年度 農業農村工学会九州支部講演会

Ito Y., Miyamoto M., Koriyama M., Chikushi J., Seguchi M. .  Measurement of interface level between fresh and salt water layers in terms of energy absorption characteristics in microwave .  Joint Symposium on Integrated Water and Soil Measurement between Water Resources University, Vietnam and Kyushu University, Japan  Joint Symposium on Integrated Water and Soil Measurement between Water Resources University, Vietnam and Kyushu University, Japan

平坂張菜，近藤文義，伊藤祐二，籾井和朗 .  ランドサットETM+データを利用した鹿児島県池田湖における水温分布の把握 .  平成22年度 農業農村工学会九州支部講演会  平成22年度 農業農村工学会九州支部講演会

Ito Y., Chikushi J., Miyamoto H. .  Multi-TDR probe designed for measuring soil moisture distribution near the soil surface .  19th World Congress of Soil Science  19th World Congress of Soil Science国際会議

近藤文義，平坂張菜，伊藤祐二，籾井和朗 .  ランドサットETM+データを利用した鹿児島県池田湖の水温調査 .  平成22年度 農業農村工学会  平成22年度 農業農村工学会

伊藤祐二，籾井和朗 .  気象変化が深い湖の水温に及ぼす影響 .  平成22年度 農業農村工学会  平成22年度 農業農村工学会

宮本英揮，伊藤直樹，間瀬淳，筑紫二郎，伊藤祐二 .  時間領域透過法による土壌水分・塩分の同時計測 .  平成22年度 農業農村工学会  平成22年度 農業農村工学会

伊藤祐二，宮本英揮，筑紫二郎 .  TDRによる水位と堆積土砂表面位の同時計測法の評価 .  平成21年度 土壌物理学会  平成21年度 土壌物理学会

宮本英揮，伊藤祐二，郡山益実，瀬口昌洋，筑紫二郎 .  周期的な水位変動場に対するTDR型境界面探査技術の適用法 .  平成21年度 農業農村工学会九州支部講演会  平成21年度 農業農村工学会九州支部講演会

伊藤祐二，宮本英揮，郡山益実，筑紫二郎，瀬口昌洋 .  マイクロ波の反射および吸収特性を利用した淡水面と淡塩水境界面の同時計測 .  平成21年度 農業農村工学会九州支部講演会  平成21年度 農業農村工学会九州支部講演会

伊藤祐二，宮本英揮，筑紫二郎 .  TDRによる水中堆積土砂表面位の評価法 .  平成21年度 農業農村工学会  平成21年度 農業農村工学会

伊藤祐二，宮本英揮，郡山益実，筑紫二郎，瀬口昌洋 .  マイクロ波の吸収特性を利用した淡塩水境界領域の検出 .  平成21年度 水文・水資源学会  平成21年度 水文・水資源学会

伊藤祐二，宮本英揮，筑紫二郎 .  TDRによる水中の堆積土砂表面位および電気伝導度の同時計測 .  平成21年度 農業農村工学会  平成21年度 農業農村工学会

伊藤祐二，宮本英揮，安永円理子，江口壽彦，筑紫二郎 .  生物環境調節学分野におけるECH2Oプローブの適用事例 .  東京大学アグリコクーン講演会  東京大学アグリコクーン講演会

宮本英揮，長裕幸，伊藤祐二，筑紫二郎，江口壽彦 .  静電容量式土壌水分センサーの電気伝導度依存性の校正 .  平成20年度 農業農村工学会九州支部講演会  平成20年度 農業農村工学会九州支部講演会

伊藤祐二，筑紫二郎，宮本英揮 .  時間領域反射法に基づく表層土壌水分計測のための多線式プロファイルプローブの開発と有効性の検討 .  平成20年度 土壌物理学会  平成20年度 土壌物理学会

伊藤祐二，籾井和朗 .  深い湖からの蒸発量におよぼす気象要素の影響: 鹿児島県池田湖の事例 .  平成20年度 水文・水資源学会  平成20年度 水文・水資源学会

面髙みさき, 籾井和朗, 伊藤祐二, 吉満由佳, 竹内真一, 中川啓 .  Bowen比法による畑地の蒸発散量の推定に関する考察 .  平成19年度 農業農村工学会九州支部講演会  平成19年度 農業農村工学会九州支部講演会

伊藤祐二，籾井和朗 .  池田湖の1981年から2005年の熱収支解析 .  平成19年度 農業農村工学会  平成19年度 農業農村工学会

Ito Y., Momii K., Nakagawa K. .  Impact of agricultural water management on lake water budget: A case study of Lake Ikeda, Japan .  International association of hydrological sciences  International association of hydrological sciences国際会議

伊藤祐二，籾井和朗，中川啓 .  農業用水管理が池田湖水位に及ぼす影響－水資源としての湖の水収支に関する研究(4)－ .  平成18年度 農業土木学会九州支部講演会  平成18年度 農業土木学会九州支部講演会

吉満由佳，籾井和朗，伊藤祐二 .  鹿児島における放射量の推定に関する研究 .  平成18年度 農業土木学会九州支部講演会  平成18年度 農業土木学会九州支部講演会

伊藤祐二，籾井和朗，中川啓 .  池田湖の熱収支に関する研究－水資源としての湖の水収支に関する研究(3)－ .  平成18年度 農業土木学会  平成18年度 農業土木学会

堀江瑠依，籾井和朗，伊藤祐二 .  池田湖の熱収支に関する基礎的研究 .  平成17年度 農業土木学会九州支部講演会  平成17年度 農業土木学会九州支部講演会

伊藤祐二 .  水収支解析による池田湖水位の推定－水資源としての湖の水収支に関する研究－ .  平成17年度 農業土木学会九州支部シンポジウム  平成17年度 農業土木学会九州支部シンポジウム

伊藤祐二，籾井和朗，中川啓 .  水収支解析による池田湖水位の推定－水資源としての湖の水収支に関する研究(2)－ .  平成17年度 農業土木学会  平成17年度 農業土木学会

伊藤祐二，籾井和朗，中川啓，長勝史 .  池田湖の水温に関する研究 －水資源としての湖の水収支に関する研究(1)－ .  平成16年度 農業土木学会九州支部講演会  平成16年度 農業土木学会九州支部講演会

Momii K., Cho K., Ito Y. .  Hydrologic and Thermal Environment of Lake Ikeda .  9th International Conference on the Conservation and Management of Lakes  9th International Conference on the Conservation and Management of Lakes国際会議

伊藤祐二，籾井和朗，長勝史 .  池田湖の放射量の推定 .  平成13年度 農業土木学会九州支部講演会  平成13年度 農業土木学会九州支部講演会

伊藤祐二，籾井和朗，長勝史 .  池田湖の蒸発量に関する研究 .  平成13年度 農業土木学会  平成13年度 農業土木学会