論文 - 池永 誠

Zin Mar Soe, Masao Sakai, Sakura Kihara, Daisuke Fukahori, Masayuki Nakamura, Daisuke Ueno, Jun-ichi Sakagami, Makoto Ikenaga .  Responses of Soil Bacteria Communities to Organic Material Application and Their Antagonistic Activity against Diaporthe destruens Causing Sweet Potato Foot Rot Disease .  Microbes and Environments40 ( 3 ) me25011 - me25011   2025年査読

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担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1264/jsme2.me25011

Shuhan Yi, Keyu Chen, Kozue Sakao, Makoto Ikenaga, Yuanliang Wang, De-Xing Hou .  Assessment of Areca Nut Bioactivities in Western Diet-Induced Mice NAFLD Model .  Nutrients15 ( 10 ) 2403 - 2403   2023年査読 国際共著

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.3390/nu15102403

Chenhua Li, Yan Li, Lisong Tang, Makoto Ikenaga, Ran Liu, Guiqing Xu .  Soil microbial community shifts explain habitat heterogeneity in two Haloxylon species from a nutrient perspective .  Ecology and Evolution76 ( 2 ) 68 - 76   2023年招待 国際共著

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1002/ece3.9727

竹腰恵, 池永誠, 富濵毅, 野口勝憲, 境雅夫 .  焼酎蒸留残液および化学合成殺菌剤による浸漬処理がジャガイモの種イモ共存細菌叢に与える影響 .  土と微生物76 ( 2 ) 68 - 76   2022年査読

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記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Masayuki Nakamura, Naoaki Tsuda, Takeshi Miyata, Makoto Ikenaga .  Antimicrobial effect and mechanism of bovine lactoferrin against the potato common scab pathogen Streptomyces scabiei .  PLOS ONE17 ( 2 ) e0264094 - e0264094   2022年査読 国際誌

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担当区分：最終著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Public Library of Science (PLoS)  

Lactoferrin (LF) is a multifunctional protein with a broad spectrum of antimicrobial activities. In this study, we investigated the antimicrobial activity of LF against the potato common scab pathogen Streptomyces scabiei, which causes severe damage to potato tubers. LF derived from bovine (bLF) had much higher activity against S. scabiei than human LF. The minimal inhibitory concentration of bLF was 3.9 μM. The effects of both apo-bLF (iron-free) and holo-bLF (iron-saturated) on S. scabiei were not different. Bovine lactoferricin (LFcinB), a short peptide with a length of 25 amino acid residues located in the N-terminal region of bLF, showed antimicrobial activity against S. scabiei, similar to that of bLF. These results indicated that the antimicrobial activity of bLF against S. scabiei cannot be attributed to its iron-chelating effect but to the bioactivity of its peptides. When S. scabiei was treated with the fusion protein of mCherry-LFcinB (red fluorescent protein) expressed in Escherichia coli, the pseudohyphal cells instantly glowed, indicating that the peptide electrostatically binds to the surface of S. scabiei. An assay of synthetic peptides, with modified number of arginine (Arg) and tryptophan (Trp) residues based on the antimicrobial center (RRWQWR) of LFcinB showed that Trp residues are implicated in the antimicrobial activity against S. scabiei; however, Arg residues are also necessary to carry Trp residues to the cell surface to fully exert its activity. Although the single amino acid effect of Trp had low activity, Trp derivatives showed much higher activity against S. scabiei, suggesting that the derivatives effectively bind to the cell surface (cell membrane) by themselves without a carrier. Thus, amino acid derivatives might be considered effective and alternative antimicrobial substances.

DOI： 10.1371/journal.pone.0264094

Scopus

PubMed

Simon Peter Dom, Makoto Ikenaga, Sharon Yu Ling Lau, Son Radu, Frazer Midot, Mui Lan Yap, Mei-Yee Chin, Mei Lieng Lo, Mui Sie Jee, Nagamitsu Maie, Lulie Melling .  Linking prokaryotic community composition to carbon biogeochemical cycling across a tropical peat dome in Sarawak, Malaysia .  Scientific Reports11 ( 1 ) 6416 - 6416   2021年査読 国際共著

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1038/s41598-021-81865-6

Makoto Ikenaga, Machi Kataoka, Xuan Yin, Aya Murouchi, Masao Sakai .  Characterization and Distribution of Agar-degrading Steroidobacter agaridevorans sp. nov., Isolated from Rhizosphere Soils .  Microbes and Environments36 ( 1 ) ME20136 - ME20136   2021年査読

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1264/jsme2.me20136

竹腰恵, 池永誠, 富濱毅, 野口勝憲, 境雅夫 .  焼酎蒸留残渣液によるジャガイモ種イモ浸漬処理が共存細菌群集およびそうか病菌に対する拮抗細菌に及ぼす影響 .  土と微生物74   32 - 41   2020年査読

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記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：日本土壌微生物学会  

DOI： 10.18946/jssm.74.1_32

ISLAM TEIBA, TAKESHI YOSHIKAWA, SUGURU OKUNISHI, MAKOTO IKENAGA, MOHAMMED EL BASUINI, HIROTO MAEDA .  Diversity of the Photosynthetic Bacterial Communities in Highly Eutrophicated Yamagawa Bay Sediments .  Biocontrol Science25   25 - 33   2020年査読

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.4265/bio.25.25

Xuan Yin, Yumiko Yoshizaki, Makoto Ikenaga, Xing-Lin Han, Kayu Okutsu, Taiki Futagami, Hisanori Tamaki, Kazunori Takamine .  Manufactural impact of the solid-state saccharification process in rice-flavor baijiu production .  Journal of Bioscience and Bioengineering129   315 - 321   2020年査読

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1016/j.jbiosc.2019.09.017

K. Shizuka, M. Ikenaga, J. Murase, N. Nakayama, N. Matsuya, W. Kakino, H. Taruya, N. Maie .  Diversity of 2-MIB producing cyanobacteria in lake Ogawara: microscopic and molecular biological approaches .  Aquaculture Science68 ( 1 ) 9 - 23   2020年査読

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担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.11233/aquaculturesci.68.9

ISLAM TEIBA, SUGURU OKUNISHI, TAKESHI YOSHIKAWA, MAKOTO IKENAGA, MOHAMMED FOUAD EL BASUINI, SHEILA MAE S SANTANDER-DE LEON, HIROTO MAEDA .  Use of Purple Non-Sulfur Photosynthetic Bacteria (Rhodobacter sphaeroides) in Promoting Ciliated Protozoa Growth .  Biocontrol Science25 ( 2 ) 81 - 89   2020年査読

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.4265/bio.25.81

Toshihiro Kojo, Mikihiko Kawai, Yohei Shiraishi, Shugo Kurazono, Chihiro Kadooka, Kayu Okutsu, Yumiko Yoshizaki, Makoto Ikenaga, Taiki Futagami, Kazunori Takamine, Hisanori Tamaki .  Effect of Maturation Time on Koji-like Smell and Volatile Compounds of Barley Miso (Japanese Soybean Paste) during Fermentation .  Food Science and Technology Research25 ( 2 ) 313 - 319   2019年査読

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.3136/fstr.25.313

Makoto Ikenaga, Shohei Katsuragi, Yoshihiro Handa, Hiroshi Katsumata, Naoya Chishaki, Tomohiro Kawauchi, Masao Sakai .  Improvements in Bacterial Primers to Enhance Selective SSU rRNA Gene Amplification of Plant-associated Bacteria by Applying the LNA Oligonucleotide-PCR Clamping Technique .  Microbes and Environments33 ( 3 ) 340 - 344   2018年査読

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1264/jsme2.me18071

IKENAGA MAKOTO, TABUCHI MASAKAZU, KAWAUCHI TOMOHIRO, SAKAI MASAO .  Application of Locked Nucleic Acid (LNA) Primer and PCR Clamping by LNA Oligonucleotide to Enhance the Amplification of Internal Transcribed Spacer (ITS) Regions in Investigating the Community Structures of Plant–Associated Fungi .  Microbes and Environments31 ( 3 ) 339 - 348   2016年査読

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担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1264/jsme2.ME16085

その他リンク： https://www.jstage.jst.go.jp/article/jsme2/31/3/31_ME16085/_pdf

Jiang Yu, Zhen-Hua Yu, Makoto Ikenaga, Masao Sakai, Xiao-Bing Liu, Guang-Hua Wang .  Effects of manure application on the diversity of corn root endophytic bacterial communities at seedling stage in eroded Mollisols .  Chinese Journal of Applied Ecology27 ( 8 ) 2663 - 2669   2016年査読 国際共著

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記述言語：中国語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.13287/j.1001-9332.201608.012

Zhen-hua YU, Jiang YU, Makoto Ikenaga, Masao Sakai, Xiao-bing LIU, Guang-hua WANG .  Characterization of root-associated bacterial community structures in soybean and corn using locked nucleic acid (LNA) oligonucleotide-PCR clamping and 454 pyrosequencing .  Journal of Integrative Agriculture15 ( 8 ) 1883 - 1891   2016年査読 国際共著

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担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1016/s2095-3119(15)61195-9

Xue Zhou, Dario Fornara, Makoto Ikenaga, Isao Akagi, Ruifu Zhang, Zhongjun Jia .  The Resilience of Microbial Community under Drying and Rewetting Cycles of Three Forest Soils .  Frontiers in microbiology7   article1101 - article1101   2016年査読 国際共著

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.01101

池永誠, 川内智裕, 境雅夫 .  分子生態学的手法を用いた植物共存細菌の多様性解析法の確立と新たな研究展開 .  土と微生物70 ( 1 ) 23 - 34   2016年招待 査読

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担当区分：筆頭著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：日本土壌微生物学会  

DOI： https://doi.org/10.18946/jssm.70.1_23

Tsuyoshi Tomihama, Yatsuka Nishi, Masao Sakai, Makoto Ikenaga, Takashi Okubo, Seishi Ikeda .  Draft genome sequences of Streptomyces scabiei S58, Streptomyces turgidiscabies T45, and Streptomyces acidiscabies a10, the pathogens of potato common scab, isolated in Japan .  Genome Announcements4   e00062-16 - e00062-16   2016年査読

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1128/genomea.00062-16

Makoto Ikenaga, Masakazu Tabuchi, Takuya Oyama, Isao Akagi, Masao Sakai .  Development of LNA oligonucleotide–PCR clamping technique in investigating the community structures of plant-associated bacteria .    79 ( 9 ) 1556 - 1566   2015年査読

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1080/09168451.2015.1038213

Masao Sakai, Daigo Deguchi, Akifumi Hosoda, Tomohiro Kawauchi, Makoto Ikenaga .  Ammoniibacillus agariperforans gen. nov., sp nov., a thermophilic, agar-degrading bacterium isolated from compost .  International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology65   570 - 577   2015年査読

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担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1099/ijs.0.067843-0

吉﨑由美子, 金顯民, 奥津果優, 池永誠, 玉置尚徳, 髙峯和則 .  韓国伝統的麹「ヌルク」を用いた焼酎製造の可能性 .  日本醸造学会誌110 ( 3 ) 170 - 178   2015年査読

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記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：日本醸造学会  

DOI： https://doi.org/10.6013/jbrewsocjapan.110.170

Rafael Guevara, Makoto Ikenaga, Amanda L. Dean, Cristina Pisani, Joseph N. Boyer .  Changes in Sediment Bacterial Community in Response to Long-Term Nutrient Enrichment in a Subtropical Seagrass-Dominated Estuary .  Microbial Ecology68 ( 3 ) 427 - 440   2014年査読 国際共著

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1007/s00248-014-0418-1

Makoto Ikenaga, Masao Sakai .  Application of Locked Nucleic Acid (LNA) Oligonucleotide–PCR Clamping Technique to Selectively PCR Amplify the SSU rRNA Genes of Bacteria in Investigating the Plant-Associated Community Structures .  Microbes and Environments29   286 - 295   2014年査読

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1264/jsme2.me14061

Masao Sakai, Akifumi Hosoda, Kenjiro Ogura, Makoto Ikenaga .  The Growth of Steroidobacter agariperforans sp. nov., a Novel Agar-Degrading Bacterium Isolated from Soil, is Enhanced by the Diffusible Metabolites Produced by Bacteria Belonging to Rhizobiales .  Microbes and Environments29 ( 1 ) 89 - 95   2014年査読

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担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1264/jsme2.me13169

Masao Sakai, Makoto Ikenaga .  Application of peptide nucleic acid (PNA)-PCR clamping technique to investigate the community structures of rhizobacteria associated with plant roots .  Journal of Microbiological Methods92 ( 3 ) 281 - 288   2013年査読

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担当区分：最終著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1016/j.mimet.2012.09.036

Tiffany G. Troxler, Makoto Ikenaga, Leonard Scinto, Joseph N. Boyer, Richard Condit, Rolando Perez, George D. Gann, Daniel L. Childers .  Patterns of Soil Bacteria and Canopy Community Structure Related to Tropical Peatland Development .  Wetlands32 ( 4 ) 769 - 782   2012年査読 国際共著

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1007/s13157-012-0310-z

Fujihara Shun, Murase Jun, Tun Cho Cho, MATSUYAMA Tomoya, IKENAGA Makoto, ASAKAWA Susumu, KIMURA Makoto .  Low diversity of T4-type bacteriophages in applied rice straw, plant residues and rice roots in Japanese rice soils: Estimation from major capsid gene (g23) composition .  Soil Science and Plant Nutrition56 ( 6 ) 800 - 812   2010年査読

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1111/j.1747-0765.2010.00513.x

Makoto Ikenaga, Rafael Guevara, Amanda L. Dean, Cristina Pisani, Joseph N. Boyer .  Changes in Community Structure of Sediment Bacteria Along the Florida Coastal Everglades Marsh–Mangrove–Seagrass Salinity Gradient .  Microbial Ecology59 ( 2 ) 284 - 295   2010年査読 国際共著

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1007/s00248-009-9572-2

Tsuchiya Yuki, Ikenaga Makoto, Kurniawan Andi, HIRAKI AYAMI, ARAKAWA TAKANORI, KUSAKABE RIE, MORISAKI HISAO .  Nutrient-Rich Microhabitats within Biofilms Are Synchronized with the External Environment .  Microbes and Environments24 ( 1 ) 43 - 51   2009年査読

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1264/jsme2.me08547

Tomoya Matsuyama, Yasunori Nakajima, Kazuo Matsuya, Makoto Ikenaga, Susumu Asakawa, Makoto Kimura .  Bacterial community in plant residues in a Japanese paddy field estimated by RFLP and DGGE analyses .  Soil Biology and Biochemistry39 ( 2 ) 463 - 472   2007年査読

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2006.08.016

Hashimoto-Yasuda Tomoko, Ikenaga Makoto, Asakawa Susumu, KIM Han-Yong, OKADA Masumi, KOBAYASHI Kazuhiko, KIMURA Makoto .  Effect of Free-Air CO2 Enrichment (FACE) on Methanogenic Archaeal Communities Inhabiting Rice Roots in a Japanese Rice Field .  Soil Science and Plant Nutrition51 ( 1 ) 91 - 100   2005年査読

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1111/j.1747-0765.2005.tb00011.x

Makoto Ikenaga, Susumu Asakawa, Yoshitetsu Muraoka, Makoto Kimura .  Community structure of eukaryotes in rice roots estimated by PCR-DGGE pattern and sequence analyses .  Soil Science and Plant Nutrition50 ( 4 ) 583 - 589   2004年査読

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担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1080/00380768.2004.10408515

Makoto Ikenaga, Susumu Asakawa, Yoshitetsu Muraoka, Makoto Kimura .  Methanogenic archaeal communities in rice roots grown in flooded soil pots: Estimation by PCR-DGGE and sequence analyses .  Soil Science and Plant Nutrition50 ( 4 ) 701 - 711   2004年査読

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担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1080/00380768.2004.10408526

Makoto Ikenaga, Susumu Asakawa, Yoshitetsu Muraoka, Makoto Kimura .  Phylogenetic study on CTO primer-amplified ammonia-oxidizing bacteria and β-Proteobacteriaassociated with rice roots grown in a flooded paddy soil .  Soil Science and Plant Nutrition49 ( 5 ) 719 - 727   2003年査読

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1080/00380768.2003.10410330

Ikenaga Makoto, Asakawa Susumu, Muraoka Yoshitetsu, KIMURA Makoto .  Bacterial communities associated with nodal roots of rice plants along with the growth stages: Estimation by PCR-DGGE and sequence analyses .  Soil Science and Plant Nutrition49 ( 4 ) 591 - 602   2003年査読

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担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1080/00380768.2003.10410049

Tun Cho Cho, Ikenaga Makoto, Asakawa Susumu, Kimura Makoto .  Community structure of bacteria and fungi responsible for rice straw decomposition in a paddy field estimated by PCR-RFLP analysis .  Soil Science and Plant Nutrition48 ( 6 ) 805 - 813   2002年査読

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1080/00380768.2002.10408706

Makoto Ikenaga, Yoshitetsu Muraoka, Koki Toyota, Makoto Kimura .  Community structure of the microbiota associated with nodal roots of rice plants along with the growth stages: estimation by PCR-RFLP analysis .  Biology and Fertility of Soils36 ( 6 ) 397 - 404   2002年査読

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担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1007/s00374-002-0543-8

Makoto Kimura, Taketoshi Shibagaki, Yasunori Nakajima, Kazuo Matsuya, Makoto Ikenaga .  Community structure of the microbiota in the floodwater of a Japanese paddy field estimated by restriction fragment length polymorphism and denaturing gradient gel electrophoresis pattern analyses .  Biology and Fertility of Soils36 ( 4 ) 306 - 312   2002年査読

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担当区分：最終著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1007/s00374-002-0526-9

Niswati Ainin, Yamazaki Masatsugu, Ikenaga Makoto, KIMURA Makoto .  Bacterial communities associated with aquatic organisms in the floodwater of a Japanese paddy field estimated by RFLP pattern analysis .  Soil Science and Plant Nutrition48 ( 2 ) 185 - 193   2002年査読

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1080/00380768.2002.10409190