2024/12/15 更新

写真a

フジタ　キヨタカ
藤田　清貴
FUJITA Kiyotaka
所属
農水産獣医学域農学系 農学部 農学科 准教授
農水産獣医学域農学系 連合農学研究科 　
職名
准教授
ホームページ
http://hypba2.jimdo.com/
外部リンク

学位

  • 博士（農学） （ 2001年3月   愛媛大学 ）

研究キーワード

  • β-アラビノオリゴ糖鎖

  • β-L-arabinofuranosidase

  • AGP

  • 食物繊維

  • 腸内細菌

  • 糖質科学

  • 糖質分解酵素

  • カラメル化糖

  • LAM

研究分野

  • その他 / その他  / 遺伝子工学

  • その他 / その他  / 酵素工学

  • ライフサイエンス / 応用生物化学  / 糖質科学

  • ライフサイエンス / 食品科学

経歴

  • 鹿児島大学   生命機能化学   准教授

    2004年4月 - 現在

  • 鹿児島大学   生物機能化学   　

    2004年4月 - 現在

所属学協会

  • 日本応用糖質科学会

  • 日本農芸化学会

  • 日本糖質学会

  • 日本生物工学会

 

論文

  • Sasaki Y., Matsuo A., Hashiguchi M., Fujimura K., Koshino H., Tanaka K., Ito Y., Kitahara K., Ishiwata A., Fujita K. .  Structural analysis of gum arabic side chains from Acacia seyal released by bifidobacterial β-arabino-oligosaccharide 3-O-β-L-arabinopyranosyl-α-L-arabinofuranosidase .  Carbohydrate Polymers349   122965   2024年11月査読

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    担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Carbohydrate Polymers  

    Gum arabic is widely used in the food and beverage industries for its emulsifying, stabilizing, and prebiotic effects, which promote Bifidobacterium growth. The two commercially approved varieties of gum arabic, namely, Acacia senegal gum and A. seyal gum, predominantly consist of arabinogalactan protein (AGP), albeit with different side chain modifications. We previously characterized two enzymes belonging to glycoside hydrolase (GH) family 39 in bifidobacteria involved in the release of α-D-Gal-(1→3)-α-L-Ara and β-L-Arap-(1→3)-α-L-Ara from the side chains of A. senegal gum. Although the carbohydrate structure of A. senegal gum is being increasingly explored, limited information is available on A. seyal gum. In this study, we discovered a novel GH39 β-arabino-oligosaccharide 3-O-β-L-arabinopyranosyl-α-L-arabinofuranosidase from Bifidobacterium catenulatum and revealed the accurate structure of β-L-arabino-oligosaccharides released from A. seyal gum as [β-L-Araf-(1→2)-]n-β-L-Arap-(1→3)-α-L-Araf-(1→) (n = 0–3). Growth assays and intracellular enzyme activity assessments using B. catenulatum revealed that β-L-arabino-oligosaccharides were degraded to L-arabinose by GH127 β-L-arabinofuranosidase and GH36 β-L-arabinopyranosidase. This study provides new insights into the diversity of AGP structures and the utilization mechanisms of A. seyal gum in bifidobacteria.

    DOI： 10.1016/j.carbpol.2024.122965

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  • Ye T., Horigome A., Kaneko H., Odamaki T., Kitahara K., Fujita K. .  Degradation mechanism of difructose dianhydride III in Blautia species .  Applied Microbiology and Biotechnology108 ( 1 ) 502   2024年11月査読

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    担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Applied Microbiology and Biotechnology  

    Abstract: Di-fructofuranose 1,2′:2,3′ dianhydride (DFA-III) is a cyclic fructo-disaccharide, which is produced by the condensation of two fructose molecules via the caramelization or enzymatic reaction of inulin fructotransferase. A strain of Blautia producta was known to utilize DFA-III as a carbohydrate source; however, the mechanisms remain unclear. In this study, we characterized the glycoside hydrolase (GH) family 91 DFA-III hydrolase (DFA-IIIase) from B. parvula NBRC 113351. Recombinant BpDFA-IIIase catalyzed the reversible conversion of DFA-III to inulobiose, which is further degraded to fructose by the cooperative action of DFA-IIIase and GH32 β-d-fructofuranosidase. DFA-III was utilized in several Blautia species with a gene cluster for DFA-III degradation (e.g., B. parvula NBRC 113351, B. hydrogenotrophica JCM 14656, and B. wexlerae JCM 35486), but not by B. wexlerae JCM 31267, which does not possess the gene cluster. Furthermore, B. hansenii JCM 14655, which cannot metabolize fructose, could not utilize DFA-III; however, it could degrade DFA-III to fructose in the presence of DFA-III-degrading enzymes. Fecal fermentation tests showed that Blautia species are important gut microbe for degrading DFA-III. Key points: • BpDFA-IIIase is the first characterized DFA-IIIase in intestinal non-pathogenic bacteria. • DFA-IIIase is widely conserved in Blautia species. • DFA-III is degraded to d -fructose through inulobiose by the cooperative action of DFA-IIIase and β- d -fructofuranosidase.

    DOI： 10.1007/s00253-024-13346-5

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    PubMed

  • Fujita K., Tsunomachi H., Lixia P., Maruyama S., Miyake M., Dakeshita A., Kitahara K., Tanaka K., Ito Y., Ishiwata A., Fushinobu S. .  Bifidobacterial GH146 β-L-arabinofuranosidase for the removal of β1,3-l-arabinofuranosides on plant glycans .  Applied Microbiology and Biotechnology108 ( 1 ) 199   2024年2月査読

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Applied Microbiology and Biotechnology  

    Abstract: l-Arabinofuranosides with β-linkages are present in several plant molecules, such as arabinogalactan proteins (AGPs), extensin, arabinan, and rhamnogalacturonan-II. We previously characterized a β-l-arabinofuranosidase from Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217, Bll1HypBA1, which was found to belong to the glycoside hydrolase (GH) family 127. This strain encodes two GH127 genes and two GH146 genes. In the present study, we characterized a GH146 β-l-arabinofuranosidase, Bll3HypBA1 (BLLJ_1848), which was found to constitute a gene cluster with AGP-degrading enzymes. This recombinant enzyme degraded AGPs and arabinan, which contain Araf-β1,3-Araf structures. In addition, the recombinant enzyme hydrolyzed oligosaccharides containing Araf-β1,3-Araf structures but not those containing Araf-β1,2-Araf and Araf-β1,5-Araf structures. The crystal structures of Bll3HypBA1 were determined at resolutions up to 1.7 Å. The monomeric structure of Bll3HypBA1 comprised a catalytic (α/α)6 barrel and two β-sandwich domains. A hairpin structure with two β-strands was observed in Bll3HypBA1, to extend from a β-sandwich domain and partially cover the active site. The active site contains a Zn2+ ion coordinated by Cys3-Glu and exhibits structural conservation of the GH127 cysteine glycosidase Bll1HypBA1. This is the first study to report on a β1,3-specific β-l-arabinofuranosidase. Key points: • β1,3- l -Arabinofuranose residues are present in arabinogalactan proteins and arabinans as a terminal sugar. • β- l -Arabinofuranosidases are widely present in intestinal bacteria. • Bll3HypBA1 is the first enzyme characterized as a β1,3-linkage-specific β- l -arabinofuranosidase.

    DOI： 10.1007/s00253-024-13014-8

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  • Shimokawa M, Ishiwata A, Kashima T, Nakashima C, Li J, Fukushima R, Sawai N, Nakamori M, Tanaka Y, Kudo A, Morikami S, Iwanaga N, Akai G, Shimizu N, Arakawa T, Yamada C, Kitahara K, Tanaka K, Ito Y, Fushinobu S, Fujita K .  Identification and characterization of endo-α-, exo-α-, and exo-β-D-arabinofuranosidases degrading lipoarabinomannan and arabinogalactan of mycobacteria. .  Nature communications14 ( 1 ) 5803 - 5803   2023年9月査読 国際誌

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    担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Nature Communications  

    The cell walls of pathogenic and acidophilic bacteria, such as Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium leprae, contain lipoarabinomannan and arabinogalactan. These components are composed of d-arabinose, the enantiomer of the typical l-arabinose found in plants. The unique glycan structures of mycobacteria contribute to their ability to evade mammalian immune responses. In this study, we identified four enzymes (two GH183 endo-d-arabinanases, GH172 exo-α-d-arabinofuranosidase, and GH116 exo-β-d-arabinofuranosidase) from Microbacterium arabinogalactanolyticum. These enzymes completely degraded the complex d-arabinan core structure of lipoarabinomannan and arabinogalactan in a concerted manner. Furthermore, through biochemical characterization using synthetic substrates and X-ray crystallography, we elucidated the mechanisms of substrate recognition and anomer-retaining hydrolysis for the α- and β-d-arabinofuranosidic bonds in both endo- and exo-mode reactions. The discovery of these d-arabinan-degrading enzymes, along with the understanding of their structural basis for substrate specificity, provides valuable resources for investigating the intricate glycan architecture of mycobacterial cell wall polysaccharides and their contribution to pathogenicity.

    DOI： 10.1038/s41467-023-41431-2

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  • Sasaki Y., Yanagita M., Hashiguchi M., Horigome A., Xiao J.Z., Odamaki T., Kitahara K., Fujita K. .  Assimilation of arabinogalactan side chains with novel 3-O-β-L-arabinopyranosyl-α-L-arabinofuranosidase in Bifidobacterium pseudocatenulatum .  Microbiome Research Reports2 ( 3 ) 12 - 12   2023年4月査読

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    担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Microbiome Research Reports  

    Aim: Dietary plant fibers affect gut microbiota composition; however, the underlying microbial degradation pathways are not fully understood. We previously discovered 3-O-α-D-galactosyl-α-L-arabinofuranosidase (GAfase), a glycoside hydrolase family 39 enzyme involved in the assimilation of side chains of arabinogalactan protein (AGP), from Bifidobacterium longum subsp. longum (B. longum) JCM7052. Although GAfase homologs are not highly prevalent in the Bifidobacterium genus, several Bifidobacterium strains possess the homologs. To explore the differences in substrate specificity among the homologs, a homolog of B. longum GAfase in Bifidobacterium pseudocatenulatum MCC10289 (MCC10289_0425) was characterized. Methods: Gum arabic, larch, wheat AGP, and sugar beet arabinan were used to determine the substrate specificity of the MCC10289_0425 protein. An amino acid replacement was introduced into GAfase to identify a critical residue that governs the differentiation of substrate specificity. The growth of several Bifidobacterium strains on β-L-arabinopyranosyl disaccharide and larch AGP was examined. Results: MCC10289_0425 was identified to be an unprecedented 3-O-β-L-arabinopyranosyl-α-L-arabinofuranosidase (AAfase) with low GAfase activity. A single amino acid replacement (Asn119 to Tyr) at the catalytic site converted GAfase into AAfase. AAfase releases sugar source from AGP, thereby allowing B. pseudocatenulatum growth. Conclusion: Bifidobacteria have evolved several homologous enzymes with overlapping but distinct substrate specificities depending on the species. They have acquired different fitness abilities to respond to diverse plant polysaccharide structures.

    DOI： 10.20517/mrr.2023.08

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  • Ishiwata A, Tsunomachi H, Kameyama K, Sophon K, Nakamura M, Kitahara K, Tanaka K, Ito Y, Fujita K .  Bifidobacterial GH146 β-L-Arabinofuranosidase (Bll4HypBA1) as the Last Enzyme for the Complete Removal of Oligoarabinofuranosides from Hydroxyproline-Rich Glycoproteins. .  Chembiochem : a European journal of chemical biology24 ( 5 ) e202200637   2023年1月査読

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    担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：ChemBioChem  

    In plant cell walls, the hydroxyproline-rich glycoproteins (HRGPs) such as extensin contain oligoarabinofuranoside linked to a hydroxyproline (Hyp) residue. The mature arabinooligosaccharide was revealed to be a tetrasaccharide (α-l-Araf-(1→3)-β-l-Araf-(1→2)-β-l-Araf-(1→2)-β-l-Araf, l-Araf4), whose linkages are targets of the bifidobacterial and Xanthomonas arabinooligosaccharide-degrading enzymes. The l-Araf4 motif was cleaved by GH43 α-l-arabinofuranosidase (Arafase) and converted to an l-Araf3-linked structure. The latter is then cleaved by GH121 β-l-arabinobiosidase (HypBA2), producing β-l-Araf-(1→2)-l-Ara (β-l-arabinobiose) and mono-β-l-Araf linked to the HRGP backbone. In bifidobacteria, the β-l-arabinobiose is then hydrolyzed by GH127 β-l-Arafase (Bll1HypBA1), a mechanistically unique cysteine glycosidase. We recently identified the distantly related homologue from Xanthomonas euvesicatoria as GH146 β-l-Arafase along with paralogues from Bifidobacterium longum, one of which, Bll4HypBA1 (BLLJ_0089), can degrade l-Araf1-Hyp in a similar way to that of GH146. As the chemical synthesis of the extensin hydrophilic motif 1 a, which possesses three distinct linkages that connect four oligoAraf residues [Hyp(l-Arafn) (n=4, 3, 1)], was achieved previously, we precisely monitored the step-wise enzymatic cleavage of 1 a in addition to that of potato lectin. The results unequivocally revealed that this enzyme specifically degrades the Hyp(l-Araf1) motif.

    DOI： 10.1002/cbic.202200637

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  • Kashima T, Okumura K, Ishiwata A, Kaieda M, Terada T, Arakawa T, Yamada C, Shimizu K, Tanaka K, Kitaoka M, Ito Y, Fujita K, Fushinobu S .  Identification of a difructose dianhydride I synthase/hydrolase from oral bacterium establishes a novel glycoside hydrolase family. .  The Journal of biological chemistry297 ( 5 ) 101324 - 101324   2021年10月査読 国際誌

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    担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Journal of Biological Chemistry  

    Fructooligosaccharides and their anhydrides are widely used as health-promoting foods and prebiotics. Various enzymes acting on β-D-fructofuranosyl linkages of natural fructan polymers have been used to produce functional compounds. However, enzymes that hydrolyze and form α-D-fructofuranosyl linkages have been less studied. Here, we identified the BBDE_2040 gene product from Bifidobacterium dentium (α-D-fructofuranosidase and difructose dianhydride I synthase/hydrolase from Bifidobacterium dentium [αFFase1]) as an enzyme with α-D-fructofuranosidase and α-D-arabinofuranosidase activities and an anomer-retaining manner. αFFase1 is not homologous with any known enzymes, suggesting that it is a member of a novel glycoside hydrolase family. When caramelized fructose sugar was incubated with αFFase1, conversions of β-D-Frup-(2→1)-α-DFruf to α-D-Fruf-1,20:2,10-β-D-Frup (diheterolevulosan II) and β-D-Fruf-(2→1)-α-D-Fruf (inulobiose) to α-D-Fruf-1,20:2,10-β- D-Fruf (difructose dianhydride I [DFA I]) were observed. The reaction equilibrium between inulobiose and DFA I was biased toward the latter (1:9) to promote the intramolecular dehydrating condensation reaction. Thus, we named this enzyme DFA I synthase/hydrolase. The crystal structures of αFFase1 in complex with β-D-Fruf and β-D-Araf were determined at the resolutions of up to 1.76 Å. Modeling of a DFA I molecule in the active site and mutational analysis also identified critical residues for catalysis and substrate binding. The hexameric structure of αFFase1 revealed the connection of the catalytic pocket to a large internal cavity via a channel. Molecular dynamics analysis implied stable binding of DFA I and inulobiose to the active site with surrounding water molecules. Taken together, these results establish DFA I synthase/hydrolase as a member of a new glycoside hydrolase family (GH172).

    DOI： 10.1016/j.jbc.2021.101324

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  • Zhu E, Hiramatsu K, Inoue T, Mori K, Tashiro K, Fujita K, Karashima T, Takashita H, Okutsu K, Yoshizaki Y, Takamine K, Tamaki H, Futagami T .  Deficiency of β-xylosidase activity in Aspergillus luchuensis mut. kawachii IFO 4308. .  Bioscience, biotechnology, and biochemistry88 ( 7 ) 816 - 823   2024年4月招待 査読 国際誌

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Bioscience, Biotechnology and Biochemistry  

    In this study, we investigated a deleterious mutation in the β-xylosidase gene, xylA (AkxylA), in Aspergillus luchuensis mut. kawachii IFO 4308 by constructing an AkxylA disruptant and complementation strains of AkxylA and xylA derived from A. luchuensis RIB2604 (AlxylA), which does not harbor the mutation in xylA. Only the AlxylA complementation strain exhibited significantly higher growth and substantial β-xylosidase activity in medium containing xylan, accompanied by an increase in XylA expression. This resulted in lower xylobiose and higher xylose concentrations in the mash of barley shochu. These findings suggest that the mutation in xylA affects xylose levels during the fermentation process. Because the mutation in xylA was identified not only in the genome of strain IFO 4308 but also the genomes of other industrial strains of A. luchuensis and A. luchuensis mut. kawachii, these findings enhance our understanding of the genetic factors that affect the fermentation characteristics.

    DOI： 10.1093/bbb/zbae046

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  • Lee S., Leclercq L.D., Guerardel Y., Szymanski C.M., Hurtaux T., Doering T.L., Katayama T., Fujita K., Aoki K., Aoki-Kinoshita K.F. .  MicroGlycoDB: A database of microbial glycans using Semantic Web technologies .  BBA Advances6   2024年1月招待 査読

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：BBA Advances  

    Glycoconjugates are present on microbial surfaces and play critical roles in modulating interactions with the environment and the host. Extensive research on microbial glycans, including elucidating the structural diversity of the glycan moieties of glycoconjugates and polysaccharides, has been carried out to investigate the function of glycans in modulating the interactions between the host and microbes, to explore their potential applications in the therapeutic targeting of pathogenic species, and in the use as probiotics in gut microbiomes. However, glycan-related information is dispersed across numerous databases and a vast amount of literature, which makes it laborious and time-consuming to identify and gather the relevant information about microbial glycosylation. This challenge can be addressed by a comprehensive database, which could offer insight into the fundamental processes underlying glycosylation. We have developed a MicroGlycoDB database to provide integrated glycan information on important model microorganisms. The data is described using Semantic Web Technologies, which allow microbial glycan data to be represented in a structured format accessible by machines, thus facilitating data sharing and integration with other resources that catalog features such as pathways, diseases, or interactions. This semantic data based on ontologies will contribute to the discovery of new knowledge in the field of microbiology, along with the expansion of information on the glycosylation of other microorganisms.

    DOI： 10.1016/j.bbadva.2024.100126

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  • Akihiro Ishiwata, Toma Kashima, Machika Kaieda, Katsunori Tanaka, Kiyotaka Fujita, Shinya Fushinobu, Yukishige Ito .  Synthesis and structural analysis of D-fructofuranosylated compounds for the analysis of GH172 difructose dianhydride I synthase/hydrolase .  Pure Appl. Chem.95 ( 9 ) in press - 964   2023年4月招待 査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Pure and Applied Chemistry  

    d-Arabinofuranosidases (Arafases) degrade the arabinan in the cell wall of acid-fast bacteria like Mycobacterium. Synthetic arabinan fragment probes could be used to investigate the function of d-Arafases, whose synthetic studies had been reported previously. The homologue of one of the arabinan-degrading enzymes, exo-α-d-Arafase, was identified as BBDE_2040 from Bifidobacterium dentium. BBDE_2040, which is a homologue of α-d-Arafase, was also observed to hydrolyze α-d-fructofuranosides (Fruf), whose linkage is found in food. In this paper, we present synthetic studies and structural analysis of the α-d-Araf and α-d-Fruf derivatives as substrates and products of the enzymatic reaction for a thorough examination of BBDE_2040. The results indicated that BBDE_2040 is a glycoside hydrolase (GH) family 172 difructose dianhydride I synthase/hydrolase and an anomer-retaining GH.

    DOI： 10.1515/pac-2023-0112

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    その他リンク： https://www.degruyter.com/document/doi/10.1515/pac-2023-0112/pdf

  • Ishiwata A., Narita S., Kimura K., Tanaka K., Fujita K., Fushinobu S., Ito Y. .  Mechanism-based inhibition of GH127/146 cysteine glycosidases by stereospecifically functionalized L-arabinofuranosides .  Bioorganic and Medicinal Chemistry75   117054 - 117054   2022年10月査読 国際誌

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Bioorganic and Medicinal Chemistry  

    To understand the precise mechanism of the glycoside hydrolase (GH) family 127, a cysteine β-L-arabinofuranosidase (Arafase) – HypBA1 – has been isolated from Bifidobacterium longum in the human Gut microbiota, and the design and synthesis of the mechanism-based inhibitors such as L-Araf-haloacetamides have been carried out. The α-L-Araf-azide derivative was used as the monoglycosylamine equivalent to afford the L-Araf-chloroacetamides (α/β-1-Cl) as well as bromoacetamides (α/β-1-Br) in highly stereoselective manner through Staudinger reaction followed by amide formation with/without anomerization. Against HypBA1, the probes 1, especially in the case of α/β-1-Br inhibited the hydrolysis. Conformational implications of these observations are discussed in this manuscript. Additional examinations using L-Araf-azides (α/β-5) resulted in further mechanistic observations of the GH127/146 cysteine glycosidases, including the hydrolysis of β-5 as the substrate and oxidative inhibition by α-5 using the GH127 homologue.

    DOI： 10.1016/j.bmc.2022.117054

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  • Ishiwata A., Fujita K., Fushinobu S., Tanaka K., Ito Y. .  Synthesis of naturally occurring β-L-arabinofuranosyl-L-arabinofuranoside structures towards the substrate specificity evaluation of β-L-arabinofuranosidase .  Bioorganic and Medicinal Chemistry68   116849 - 116849   2022年5月査読 国際誌

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Bioorganic and Medicinal Chemistry  

    Methyl β-L-arabinofuranosyl-(1 → 2)-, -(1 → 3)-, and -(1 → 5)-α-L-arabinofuranosides have been stereoselectively synthesized through 2-naphthylmethyl ether-mediated intramolecular aglycon delivery (NAP-IAD), whose β-linkages were confirmed by NMR analysis on the 3JH1–H2 coupling constant and 13C chemical shift of C1. The NAP-IAD approach was simply extended for the synthesis of trisaccharide motifs possessing β-L-arabinofuranosyl-(1 → 5)-L-arabinofuranosyl non-reducing terminal structure with the branched β-L-arabinofuranosyl-(1 → 5)-[α-L-arabinofuranosyl-(1 → 3)]-α-L-arabinofuranosyl and the liner β-L-arabinofuranosyl-(1 → 5)-β-L-arabinofuranosyl-(1 → 5)-β-L-arabinofuranosyl structures in olive arabinan and dinoflagellate polyethers, respectively. The results on the substrate specificity of a bifidobacterial β-L-arabinofuranosidase HypBA1 using the regioisomers indicated that HypBA1 could hydrolyze all three linkages however behaved clearly less active to β-(1 → 5)-linked disaccharide than other two regioisomers including the proposed natural degradation product, β-(1 → 2)-linked one from plant extracellular matrix such as extensin. On the other hand, Xanthomonas XeHypBA1 was found to hydrolyze all three disaccharides as the substrate with higher specificity to β-(1 → 2)-linkage than bifidobacterial HypBA1.

    DOI： 10.1016/j.bmc.2022.116849

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  • Masahiro Komeno, Yuki Yoshihara, Junya Kawasaki, Wataru Nabeshima, Koshi Maeda, Yuki Sasaki, Kiyotaka Fujita, Hisashi Ashida .  Two α-l-arabinofuranosidases from Bifidobacterium longum subsp. longum are involved in arabinoxylan utilization .  Applied Microbiology and Biotechnology106 ( 5-6 ) 1957 - 1965   2022年3月査読 国際誌

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Applied Microbiology and Biotechnology  

    Abstract: Arabinoxylan (AX) and arabinoxylooligosaccharides (AXOs) are carbohydrate sources utilized by Bifidobacterium longum subsp. longum. However, their degradation pathways are poorly understood. In this study, we characterized two genes, BLLJ_1850 and BLLJ_1851, in the hemicellulose-degrading gene cluster (BLLJ_1836–BLLJ_1859) of B. longum subsp. longum JCM 1217. Both recombinant enzymes expressed in Escherichia coli exhibited exo-α-l-arabinofuranosidase activity toward p-nitrophenyl-α-l-arabinofuranoside. BlArafE (encoded by BLLJ_1850) contains the glycoside hydrolase family 43 (GH43), subfamily 22 (GH43_22), and GH43_34 domains. The BlArafE GH43_22 domain was demonstrated to release α1,3-linked Araf from AX, but the function of BlArafE GH43_34 could not be clearly identified in this study. BlArafD (encoded by BLLJ_1851) contains GH43 unclassified subfamily (GH43_UC) and GH43_26 domains. The BlArafD GH43_UC domain showed specificity for α1,2-linked Araf in α1,2- and α1,3-Araf double-substituted structures in AXOs, while BlArafD GH43_26 was shown to hydrolyze α1,5-linked Araf in the arabinan backbone. Co-incubation of BlArafD and BlArafE revealed that these two enzymes sequentially removed α1,2-Araf and α1,3-Araf from double-substituted AXOs in this order. B. longum strain lacking BLLJ_1850–BLLJ_1853 did not grow in the medium containing α1,2/3-Araf double-substituted AXOs, suggesting that BlArafE and BlArafD are important for the assimilation of AX. Key points: • BlArafD GH43 unclassified subfamily domain is a novel α1,2-l-arabinofuranosidase. • BlArafE GH43 subfamily 22 domain is an α1,3-l-arabinofuranosidase. • BlArafD and BlArafE cooperatively degrade α1,2/3-Araf double-substituted arabinoxylan. Graphical abstract: [Figure not available: see fulltext.]

    DOI： 10.1007/s00253-022-11845-x

    Scopus

    PubMed

  • Sasaki Y, Komeno M, Ishiwata A, Horigome A, Odamaki T, Xiao JZ, Tanaka K, Ito Y, Kitahara K, Ashida H, Fujita K .  Mechanism of Cooperative Degradation of Gum Arabic Arabinogalactan Protein by Bifidobacterium longum Surface Enzymes. .  Applied and environmental microbiology88 ( 6 ) aem0218721   2022年2月査読 国際誌

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    担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1128/aem.02187-21

    PubMed

  • 鹿島 騰真, 石渡 明弘, 藤田 清貴, 伏信 進矢 .  カラメルに含まれるオリゴ糖を分解する酵素の同定と構造基盤 .  生物物理62 ( 3 ) 184 - 186   2022年招待

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：一般社団法人 日本生物物理学会  

    <p>ヒトは火を使って調理することでカラメルのように天然には存在しない糖質を含んだ食品を生み出している．私達はビフィズス菌でカラメル化糖に含まれるinulobioseの脱水縮合を平衡的に触媒し，difructose dianhydride I（DFA I）を生成するDFA I synthase/hydrolase（αFFase1）を発見した．本稿ではαFFase1の機能を特定した経緯とX線結晶構造解析による構造基盤について述べる．</p>

    DOI： 10.2142/biophys.62.184

  • Maruyama S, Sawano K, Amaki S, Suzuki T, Narita S, Kimura K, Arakawa T, Yamada C, Ito Y, Dohmae N, Fujita K, Ishiwata A, Fushinobu S .  Substrate complex structure, active site labeling and catalytic role of the zinc ion in cysteine glycosidase. .  Glycobiology   2021年10月招待 査読

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    記述言語：英語  

    DOI： 10.1093/glycob/cwab103

    PubMed

  • Sasaki Yuki, Uchimura Yumi, Kitahara Kanefumi, Fujita Kiyotaka .  Characterization of a GH36 α-D-Galactosidase Associated with Assimilation of Gum Arabic in Bifidobacterium longum subsp. longum JCM7052 .  Journal of Applied Glycoscience68 ( 2 ) 47 - 52   2021年5月査読

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    担当区分：責任著者   記述言語：英語   出版者・発行元：(一社)日本応用糖質科学会  

  • Sasaki Y, Horigome A, Odamaki T, Xiao JZ, Ishiwata A, Ito Y, Kitahara K, Fujita K .  Novel 3-O-α-D-galactosyl-α-L-arabinofuranosidase for the assimilation of gum arabic arabinogalactan protein in Bifidobacterium longum subsp. longum .  Appl. Environ. Microbiol.87 ( 10 ) e02690 - 02620   2021年4月査読

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    担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1128/AEM.02690-20

    PubMed

  • Yamamoto I, Ueno Y, Geshi M, Inagaki Y, Odamaki T, Fujita K. .  Complete genome sequence of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM7052 .  Microbiol. Resour. Announc.10   e01193-011   2021年4月査読

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    担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1128/MRA.01193-20

  • Saito K, Viborg AH, Sakamoto S, Arakawa T, Yamada C, Fujita K, Fushinobu S. .  Crystal structure of β-L-arabinobiosidase belonging to glycoside hydrolase family 121 .  PLoS ONE15 ( 6 ) e0231513   2020年6月査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    © 2020 Saito et al. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited. Enzymes acting on α-L-arabinofuranosides have been extensively studied; however, the structures and functions of β-L-arabinofuranosidases are not fully understood. Three enzymes and an ABC transporter in a gene cluster of Bifidobacterium longum JCM 1217 constitute a degradation and import system of β-L-arabinooligosaccharides on plant hydroxyproline-rich glycoproteins. An extracellular β-L-arabinobiosidase (HypBA2) belonging to the glycoside hydrolase (GH) family 121 plays a key role in the degradation pathway by releasing β-1,2-linked arabinofuranose disaccharide (β-Ara2) for the specific sugar importer. Here, we present the crystal structure of the catalytic region of HypBA2 as the first three-dimensional structure of GH121 at 1.85 Å resolution. The HypBA2 structure consists of a central catalytic (α/α)6 barrel domain and two flanking (N- and C-terminal) β-sandwich domains. A pocket in the catalytic domain appears to be suitable for accommodating the β-Ara2 disaccharide. Three acidic residues Glu383, Asp515, and Glu713, located in this pocket, are completely conserved among all members of GH121; site-directed mutagenesis analysis showed that they are essential for catalytic activity. The active site of HypBA2 was compared with those of structural homologs in other GH families: GH63 α-glycosidase, GH94 chitobiose phosphorylase, GH142 β-L-arabinofuranosidase, GH78 α-L-rhamnosidase, and GH37 α,α-trehalase. Based on these analyses, we concluded that the three conserved residues are essential for catalysis and substrate binding. β-L-Arabinobiosidase genes in GH121 are mainly found in the genomes of bifidobacteria and Xanthomonas species, suggesting that the cleavage and specific import system for the β-Ara2 disaccharide on plant hydroxyproline-rich glycoproteins are shared in animal gut symbionts and plant pathogens.

    DOI： 10.1371/journal.pone.0231513

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    PubMed

  • Miyake M, Terada T, Shimokawa M, Sugimoto N, Arakawa T, Shimizu K, Igarashi K, Fujita K, and Fushinobu, S. .  Structural analysis of β-L-arabinobiose-binding protein in the metabolic pathway of hydroxyproline-rich glycoproteins in Bifidobacterium longum. .  FEBS J.287 ( 23 ) 5114 - 5129   2020年4月査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Bifidobacterium longum is a symbiotic human gut bacterium that has a degradation system for β-arabinooligosaccharides, which are present in the hydroxyproline-rich glycoproteins of edible plants. Whereas microbial degradation systems for α-linked arabinofuranosyl carbohydrates have been extensively studied, little is understood about the degradation systems targeting β-linked arabinofuranosyl carbohydrates. We functionally and structurally analyzed a substrate-binding protein (SBP) of a putative ABC transporter (BLLJ_0208) in the β-arabinooligosaccharide degradation system. Thermal shift assays and isothermal titration calorimetry revealed that the SBP specifically bound Araf-β1,2-Araf (β-Ara2 ) with a Kd of 0.150 μm, but did not bind L-arabinose or methyl-β-Ara2 . Therefore, the SBP was termed β-arabinobiose-binding protein (BABP). Crystal structures of BABP complexed with β-Ara2 were determined at resolutions of up to 1.78 Å. The findings showed that β-Ara2 was bound to BABP within a short tunnel between two lobes as an α-anomeric form at its reducing end. BABP forms extensive interactions with β-Ara2 , and its binding mode was unique among SBPs. A molecular dynamics simulation revealed that the closed conformation of substrate-bound BABP is stable, whereas substrate-free form can adopt a fully open and two distinct semi-open states. The importer system specific for β-Ara2 may contribute to microbial survival in biological niches with limited amounts of digestible carbohydrates. DATABASE: Atomic coordinates and structure factors (codes 6LCE and 6LCF) have been deposited in the Protein Data Bank (http://wwpdb.org/).

    DOI： 10.1111/febs.15315

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  • Katayama K. .  New Sweetpotato Lines have High Amylose and Resistant Starch Contents .  Starch/Staerke71 ( 3-4 )   2019年3月査読

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    記述言語：英語   出版者・発行元：Starch/Staerke  

    DOI： 10.1002/star.201800180

    Web of Science

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  • Komeno M, Hayamizu H, Fujita K, Ashida H .  Two novel α-L-arabinofuranosidases from Bifidobacterium longum subsp. longum belonging to glycoside hydrolase family 43 cooperatively degrade arabinan. .  Applied and environmental microbiology85 ( 6 )   2019年3月査読

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    記述言語：英語  

    DOI： 10.1128/AEM.02582-18

    Scopus

    PubMed

  • M. Komeno, H. Hayamizu, K. Fujita, H. Ashida .  Two Novel α-L-Arabinofuranosidases from Bifidobacterium longum subsp. longum Belonging to Glycoside Hydrolase Family 43 Cooperatively Degrade Arabinan. .    85   e02582-18   2019年1月招待 査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita K, Sakamoto A, Kaneko S, Kotake T, Tsumuraya Y, Kitahara K .  Degradative enzymes for type II arabinogalactan side chains in Bifidobacterium longum subsp. longum. .  Appl. Microbiol. Biotech.103   1299 - 1310   2019年1月査読

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s00253-018-9

  • Wade Abbott, Orly Alber, Ed Bayer, Jean-Guy Berrin, Alisdair Boraston, Harry Brumer, Ryszard Brzezinski, Anthony Clarke, Beatrice Cobucci-Ponzano, Darrell Cockburn, Pedro Coutinho, Mirjam Czjzek, Bareket Dassa, Gideon John Davies, Vincent Eijsink, Jens Eklof, Alfons Felice, Elizabeth Ficko-Blean, Geoff Pincher, Thierry Fontaine, Zui Fujimoto, Kiyotaka Fujita, Shinya Fushinobu, Harry Gilbert, Tracey Gloster, Ethan Goddard-Borger, Ian Greig, Jan-Hendrik Hehemann, Glyn Hemsworth, Bernard Henrissat, Masafumi Hidaka, Ramon Hurtado-Guerrero, Kiyohiko Igarashi, Takuya Ishida, Stefan Janecek, Seino Jongkees, Nathalie Juge, Satoshi Kaneko, Takane Katayama, Motomitsu Kitaoka, Naotake Konno, Daniel Kracher, Anna Kulminskaya, Alicia Lammerts van Bueren, Sine Larsen, Junho Lee, Markus Linder, Leila LoLeggio, Roland Ludwig, Ana Luis, Mirko Maksimainen, Brian Mark, Richard McLean, Gurvan Michel, Gurvan Michel, Cedric Montanier, Marco Moracci, Haruhide Mori, Hiroyuki Nakai, Wim Nerinckx, Takayuki Ohnuma, Richard Pickersgill, Kathleen Piens, Tirso Pons, Etienne Rebuffet, Peter Reilly, Magali Remaud-Simeon, Brian Rempel, Kyle Robinson, David Rose, Juha Rouvinen, Wataru Saburi, Yuichi Sakamoto, Mats Sandgren, Fathima Shaikh, Yuval Shoham, Franz St John, Jerry Stahlberg, Michael Suits, Gerlind Sulzenbacher, Tomomi Sumida, Ryuichiro Suzuki, Birte Svensson, Toki Taira, Ed Taylor, Takashi Tonozuka, Breeanna Urbanowicz, Gustav Vaaje-Kolstad, Wim Van den Ende, Annabelle Varrot, Maxime Versluys, Florence Vincent, David Vocadlo, Warren Wakarchuk, Tom Wennekes, Rohan Williams, Spencer Williams, David Wilson, Stephen Withers, Katsuro Yaoi, Vivian Yip, Ran Zhang .  Ten years of CAZypedia: a living encyclopedia of carbohydrate-active enzymes .  GLYCOBIOLOGY28 ( 1 ) 3 - 8   2018年1月国際共著

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    記述言語：英語   出版者・発行元：OXFORD UNIV PRESS INC  

    CAZypedia was initiated in 2007 to create a comprehensive, living encyclopedia of the carbohydrate active enzymes (CAZymes) and associated carbohydrate-binding modules involved in the synthesis, modification and degradation of complex carbohydrates. CAZypedia is closely connected with the actively curated CAZy database, which provides a sequence-based foundation for the biochemical, mechanistic and structural characterization of these diverse proteins. Now celebrating its 10th anniversary online, CAZypedia is a successful example of dynamic, community-driven and expert-based biocuration. CAZypedia is an open-access resource available at URL http://www.cazypedia.org.

    DOI： 10.1093/glycob/cwx089

    Web of Science

  • Sasaki, Y., Togo, N., Kitahara, K., and Fujita, K. .  Characterization of a GH36 β-L-Arabinopyranosidase in Bifidobacterium adolescentis .  J. Appl. Glycosci.65 ( 2 ) 23 - 30   2018年招待 査読

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    担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.5458/jag.jag.JAG-2018_001

    Web of Science

  • Nakamura, M., Yasukawa, Y., Furusawa, A., Fuchiwaki, T., Honda, T., Okamura, Y., Fujita, K., Iwai, H. .  Functional characterization of unique enzymes in Xanthomonas euvesicatoria related to degradation of arabinofurano-oligosaccharides on hydroxyproline-rich glycoproteins. .  PLoS One9   e0201982   2018年査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Nakamura M, Yasukawa Y, Furusawa A, Fuchiwaki T, Honda T, Okamura Y, Fujita K, Iwai H .  Functional characterization of unique enzymes in Xanthomonas euvesicatoria related to degradation of arabinofurano-oligosaccharides on hydroxyproline-rich glycoproteins. .  PloS one13 ( 8 ) e0201982   2018年

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    出版者・発行元：PLoS ONE  

    DOI： 10.1371/journal.pone.0201982

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  • 藤田 清貴 .  ビフィズス菌がもつ糖タンパク質糖鎖の分解代謝システム:ビフィズス菌を増やすプレバイオティック糖タンパク質 .  化学と生物55 ( 4 ) 242 - 248   2017年招待 査読

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：公益社団法人 日本農芸化学会  

    <p>ビフィズス菌は私たちの腸内環境を健全に保つうえで欠かすことができない腸内細菌であり，大腸に生息し私たちと共生関係を構築している．ビフィズス菌は，オリゴ糖だけではなく糖タンパク質や多糖を含めたさまざまな難消化性糖質を分解代謝することができる．近年，ビフィズス菌がもつユニークな糖質分解酵素群の発見により，糖タンパク質や多糖がプレバイオティクスとしてビフィズス菌を増やす仕組みが明らかになってきた．本稿では，ビフィズス菌がもつ糖タンパク質糖鎖の分解代謝システムを中心に，ビフィズス菌の糖質獲得戦略を解説する．</p>

    DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu.55.242

    J-GLOBAL

  • Shimokawa, M., Kitahara, K., and Fujita, K. .  Characterization of a β-L-arabinopyranosidase from Bifidobacterium longum subsp. longum. .  J. Appl. Glycosci.62   1 - 6   2015年2月査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Kitahara, K., yamasaki T., Fujita, K., and Suganuma, T. .  Physicochemical Properties of Starches from Recently Bred Sweetpotatoes in Japan. .  J. Appl. Glycosci.61   81 - 88   2014年8月査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., Sakaguchi, T., Sakamoto, A., Shimokawa, M., and Kitahara, K. .  Bifidobacterium longum subsp. longum exo-β-1,3-galactanase, an enzyme for the degradation of type II arabinogalactan. .  Appl. Environ. Microbiol.80 ( 15 ) 4577 - 4584   2014年8月査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • 時村金愛，下園英俊，久米隆志，西原悟，小山田耕作，福元伸一，藤田清貴，北原兼文 .  栽培条件の異なるサツマイモ新品種「こなみずき」塊根の澱粉品質 .  応用糖質科学4 ( 3 ) 234 - 240   2014年8月査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., Takashi, Y., Obuchi, E., Kitahara, K., and Suganuma, T. .  Characterization of a novel β-L-arabinofuranosidase in Bifidobacterium longum: Functional elucidation of a DUF1680 protein family member. .  J. Biol. Chem.289   5240 - 5249   2014年2月査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Ito, T., Saikawa, K., Kim, S., Fujita, K., Ishiwata, A., Kaeothip, S., Arakawa, T., Wakagi, T., Beckham G. T., Ito, Y., and Fushinobu, S. .  Crystal structure of glycoside hydrolase family 127 β-L-arabinofuranosidase from Bifidobacterium longum. .  Biochem. Biophys. Res. Commun.447   32 - 37   2014年1月査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Kaeothip, S., Ishiwata, A., Ito, T., Fushinobu, S., Fujita, K., Ito., Y. .  Preparation of p-nitrophenyl β-L-arabinofuranoside as a substrate of β-L-arabinofuranosidase. .  Carbohydr. Res.382   95 - 100   2013年査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Kitahara, K., Takahata, Y., Otani, M., Tanaka, M., Katayama, K., Yoshinaga, M., Fujita, K., and Suganuma, T. .  Starch properties of transgenic sweetpotato plants modified by RNA interference of the starch synthase II gene. .  J. Appl. Glycosci.58 ( 3 ) 85 - 90   2011年9月査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., Sakamoto, S., Ono, Y., Wakao, M., Suda, Y., Kitahara, K., and Suganuma, T. .  Molecular cloning and characterization of a β-L-arabinobiosidase in Bifidobacterium longum that belongs to a novel glycoside hydrolase family. .  J. Biol. Chem.286 ( 7 ) 5143 - 5150   2011年2月査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Al-Dabbas, M. M., Al-Ismail, K., Abu-Taleb, R., Hashimoto, F., Rabah, I. O., Kitahara, K. Fujita, K., and Suganuma, T. .  Chemistry and antiproliferative activities of 3-methoxyflavones isolated from Varthemia iphionoides. .  Chem. Nat. Comp.47   17 - 21   2011年査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Ashida H, Ozawa H, Fujita K, Suzuki S, Yamamoto K. .  Syntheses of mucin-type O-glycopeptides and oligosaccharides using transglycosylation and reverse-hydrolysis activities of Bifidobacterium endo-α-N-acetylgalactosaminidase. .  Glycoconj. J.27   125 - 132   2010年査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Umekawa, M., Huang, W., Li, B., Fujita, K., Ashida, H., Wang, L. X., and Yamamoto, K. .  Mutants of Mucor hiemalis endo-β-N-acetylglucosaminidase show enhanced transglycosylation and glycosynthase-like activities. .  J. Biol. Chem.283   4469 - 4479   2008年2月査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., Sato, R., Toma, K., Kitahara, K., Suganuma, T., Yamamoto, K., and Takegawa, K. .  Identification of the catalytic acid-base residue of Arthrobacter endo-b-N-acetylglucosaminidase by chemical rescue of an inactive mutant. .  J. Biochem.142 ( 3 ) 301 - 306   2007年9月査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Kitahara, K., Hamasuna, K., Nozuma, K., Otani, M., Hamada, T., Shimada, T., Fujita, K., and Suganuma, T. .  Physicochemical properties of amylose-free and high-amylose starches from transgenic sweetpotatoes modified by RNA interference. .  Carbohydrate Polymers69   233 - 240   2007年1月査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., and Yamamoto, K. .  A remodeling system for the oligosaccharide chains on glycoproteins with microbial endo-b-N-acetylglucosaminidases. .  Biochim. Biophis. Acta.・ELSEVIER1760 ( 11 ) 1631 - 1635   2006年11月査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., Oura, F., Nagamine, N., Katayama, T., Hiratake, J., Sakata, K., Kumagai, H., and Yamamoto, K .  Identification and molecular cloning of a novel glycoside hydrolase family of core 1 type O-glycan-specific endo-a-N-acetylgalactosaminidase from Bifidobacterium longum. .  J. Biol. Chem.・HighWire Press280 ( 45 ) 37415 - 37422   2005年11月査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Yamanoi, T., Yoshida, N., Oda, Y., Akaike, E., Tsutsumida, M., Kobayashi, N., Osumi, K., Yamamoto, K., Fujita, K., Takahashi, K., and Hattori, K. .  Synthesis of mono-glucose-branched cyclodextrins with a high inclusion ability for doxorubicin and their efficient glycosylation using Mucor hiemalis endo-β-N-acetylglucosaminidase .  Bioorg. Med. Chem. Lett.15   1009 - 1013   2005年査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., Takami, H., Yamamoto, K., and Takegawa, K. .  Characterization of endo-β-N-acetylglucosaminidase from alkaliphilic Bacillus halodurans C-125 .  Biosci. Biotechnol. Biochem., ・JSBA68 ( 5 ) 41 - 49   2004年12月査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., Kobayashi, K., Iwamatsu, A., Takeuchi, M., Kumagai, H., and Yamamoto, K. .  Molecular cloning of Mucor hiemalis endo-b-N-acetylglucosaminidase and some properties of the recombinant enzyme. .  Arch. Biochem. Biophys., ・ELSEVIER432 ( 1 ) 1059 - 1066   2004年5月査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Akaike, E., Tsutsumida, M., Osumi, K., Fujita, M., Yamanoi, T., Yamamoto, K., and Fujita, K. .  High efficiency of transferring a native sugar chain from a glycopeptide by a microbial endoglycosidase in organic solvents .  Carbohydr. Res.339   719 - 722   2004年1月査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Yamanoi, T., Tsutsumida, M., Oda, Y., Akaike, E., Osumi, K., Yamamoto, K., and Fujita, K. .  Transglycosylation reaction of Mucor hiemalis endo-β-N-acetylglucosaminidase using sugar derivatives modified at C-1 or C-2 as oligosaccharide acceptors .  Carbohydr. Res.339   1403 - 1406   2004年査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Mizutani, K., Okamoto, I., Fujita, K., Yamamoto, K., and Hirose, M. .  Structural and functional characterization of ovotransferrin produced by Pichia pastoris .  Biosci. Biotechnol. Biochem.68   376 - 383   2004年査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Osumi, K., Makino, Y., Akaike, E., Yamanoi, T., Mizuno, M., Noguchi, M., Inazu, T., Yamamoto, K., and Fujita, K. .  Mucor hiemalis endo-β-N-acetylglucosaminidase can transglycosylate a bisecting hybrid-type oligosaccharide from an ovalbumin glycopeptide .  Carbohydr. Res.339   2633 - 2635   2004年査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., Tsuyoshi, M., Sano, M., Kato, I., and Takegawa, K. .  Transfer of high-mannose-type oligosaccharides to disaccharides by endo-β-N-acetylglucosaminidase from Arthrobacter protophormiae .  J. Biosci. Bioeng.93 ( 6 ) 614 - 617   2002年6月査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Kato, T., Fujita, K., Takeuchi, M., Kobayashi, K., Natsuka, S., Ikura, K., Kumagai, H., and Yamamoto, K. .  Identification of an endo-β-N-acetylglucosaminidase gene in Caenorhabditis elegans and its expression in Escherichia coli .  Glycobiology12   581 - 587   2002年査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., and Takegawa, K. .  Chemoenzymatic synthesis of neoglycoproteins using transglycosylation with endo-β-N-acetylglucosaminidase A .  Biochem. Biophys. Res. Commun.2825   678 - 682   2001年1月査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., and Takegawa, K. .  Tryptophan-216 is essential for the transglycosylation activity of endo-β-N-acetylglucosaminidase A .  Biochem. Biophys. Res. Commun.283   680 - 686   2001年査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., Nakatake, R., Yamabe, K., Watanabe, A., Asada, Y., and Takegawa, K. .  Identification of amino acid residues essential for the substrate specificity of Flavobacterium sp. endo-β-N-acetylglucosaminidase .  Biosci. Biotechnol. Biochem.65   1542 - 1548   2001年査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., Asada, Y., Yamamoto, K., and Takegawa, K. .  Plate assay for endo-β-N-acetylglucosaminidase activity using a chromogenic substrate synthesized by transglycosylation with Arthrobacter endo-β-N-acetylglucosaminidase .  J. Biosci. Bioeng.90 ( 4 ) 462 - 464   2000年4月査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Fujita, K., Tanaka, N., Sano, M., Kato, I., Asada, Y., and Takegawa, K. .  Synthesis of neoglycoenzymes with homogeneous N-linked oligosaccharides using immobilized endo-β-N-acetylglucosaminidase A .  Biochem. Biophys. Res. Commun.267   134 - 138   2000年査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Bhuiyan, M. S., Ito, Y., Nakamura, A., Tanaka, N., Fujita, K., Fukui, H.,and Takegawa, K. .  Nystatin effects on vacuolar function in Saccharomyces cerevisiae .  Biosci. Biotechnol. Biochem.63   1075 - 1082   1999年査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Tanaka, N., Awai, A., Bhuiyan, M. S., Fujita, K., Fukui, H., and Takegawa, K. .  Cell surface galactosylation is essential for nonsexual flocculation in Schizosaccharomyces pombe .  J. Bacteriol.181   1356 - 1359   1999年査読

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Takegawa, K., Fujita, K., Fan, J. Q., Tabuchi, M., Tanaka, N., Kondo, A., Iwamoto, H., Kato, I., Lee, Y. C., and Iwahara, S. .  Enzymatic synthesis of a neoglycoconjugate by transglycosylation with Arthrobacter endo-β-N-acetylglucosaminidase: A substrate for colorimetric detection of endo-β-N-acetylglucosaminidase activity. .  Anal. Biochem.257   218 - 223   1998年査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

  • Takegawa, K., Yamabe, K., Fujita, K., Tabuchi, M., Mita, M., Izu, H., Watanabe, A., Asada, Y., Sano, M., Kondo, A., Kato, I., and Iwahara, S. .  Cloning, sequencing, and expression of Arthrobacter protophormiae endo-β-N-acetylglucosaminidase in Escherichia coli .  Arch. Biochem. Biophys.338   24 - 28   1997年査読

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

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書籍等出版物

  • 第7章 エンドAの構造から糖タンパク質合成の最適条件を探る

    竹川薫、藤田清貴（ 担当： 共著）

    「バイオ医薬品開発における糖鎖技術」早川堯夫・掛樋一晃・平林 淳監修・シーエムシー出版  2011年11月 

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    記述言語：日本語 著書種別：学術書

  • 酵素的切断法・(2)O-グリコシド結合の酵素分解

    藤田清貴，山本憲二（ 担当： 共著）

    「糖質II糖タンパク質実験法」生物薬科学実験講座4卷・川嵜敏祐編・廣川書店  2011年7月 

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    記述言語：日本語 著書種別：学術書

  • Remodeling of Sugar Chains by Endo-M, in: Endo, M., Hase, S., Yamamoto, K., and Takagaki, K. (Eds.),

    Fujita, K., and Yamamoto, K.（ 担当： 共著）

    Endoglycosidases: Biochemistry, Biotechnology, Application ・Kodansha  2006年1月 

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    記述言語：英語 著書種別：学術書

MISC

  • 結核菌の細胞壁糖鎖を分解する新規酵素群の同定と構造基盤 招待

    鹿島 騰真, 下川 倫子, 石渡 明弘, 藤田 清貴, 伏信 進矢

    日本結晶学会誌   66 ( 3 )   171 - 172   2024年8月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本結晶学会  

    DOI： 10.5940/jcrsj.66.171

  • Role of β-L-Arabinofuranosidases in Intestinal Bacteria 招待 査読

    Fujita K., Ishiwata A., Fushinobu S.

    Ｔｒｅｎｄｓ　ｉｎ　Ｇｌｙｃｏｓｃｉｅｎｃｅ　ａｎｄ　Ｇｌｙｃｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ   36 ( 210 )   E35 - E38   2024年3月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）   出版者・発行元：FCCA(Forum: Carbohydrates Coming of Age)  

    β-L-Arabinofuranosidase (β-Arafase) is an enzyme belonging to the glycoside hydrolase families GH127/137/142/146 that hydrolyze β-L-arabinofuranoside (Araf) from plant polysaccharides and glycoproteins. With the development of functional and structural analyses of β-Arafases from major human intestinal bacteria Bifidobacterium longum ssp. longum and Bacteroides thetaiotao-micron, the importance of β-Arafase to remove modified sugars has been revealed for the efficient degradation of dietary fibers by the intestinal bacteria. This minireview describes the distribution of β-Araf in plant polysaccharides and glycoproteins and the findings revealed by functional and structural studies of β-Arafases from intestinal bacteria.

    DOI： 10.4052/tigg.2306.1e

    Scopus

  • 腸内細菌におけるβ-L-アラビノフラノシダーゼの役割 招待 査読

    藤田 清貴, 石渡 明弘, 伏信 進矢

    Ｔｒｅｎｄｓ　ｉｎ　Ｇｌｙｃｏｓｃｉｅｎｃｅ　ａｎｄ　Ｇｌｙｃｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ   36 ( 210 )   J35 - J38   2024年3月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）   出版者・発行元：FCCA(Forum: Carbohydrates Coming of Age)  

    <p>糖加水分解酵素ファミリー127/137/142/146に属するβ-L-arabinofuranosidase（β-Ara<i>f</i>ase）は、植物多糖や植物糖タンパク質の修飾糖であるβ-L-アラビノフラノシド（Ara<i>f</i>）を分解する糖質加水分解酵素である。ヒトの主要な腸内細菌であるビフィズス菌<i>Bifidobacterium longum</i> ssp. <i>longum</i>やバクテロイデス属細菌<i>Bacteroides thetaiotaomicron</i>由来のβ-Ara<i>f</i>aseの機能解析と結晶構造解析の進展により、腸内細菌が食物繊維を効率良く分解するために、修飾糖の除去を担うβ-Ara<i>f</i>aseの重要性が明らかになってきた。本ミニレビューでは、植物多糖や植物糖タンパク質におけるβ-Ara<i>f</i>の分布と腸内細菌由来のβ-Ara<i>f</i>aseの機能・構造解析によって明らかにされた知見について解説する。</p>

    DOI： 10.4052/tigg.2306.1j

    DOI： 10.4052/tigg.2306.1J

  • ビフィズス菌におけるアラビアガム分解代謝機構の解明

    佐々木 優紀, 北原 兼文, 藤田 清貴

    応用糖質科学   12 ( 2 )   108 - 116   2022年5月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本応用糖質科学会  

    アラビアガムは、マメ科アカシア属の木から得られる滲出物であり、ヒトの腸内でビフィズス菌を増殖させるプレバイオティクスとしての機能がある。分子構造の大部分はII型アラビノガラクタン鎖で構成されており、側鎖に多様な修飾糖が付加することで複雑な構造を有している。ビフィズス菌によるカラマツ由来のII型AGの分解機構が明らかになったものの、これらの酵素群はアラビアガムには作用せず、ビフィズス菌の増殖機構は不明であった。筆者らはB.longumのアラビアガム資化性が菌株特異的であることに着目し、資化性試験と比較ゲノム解析によって、資化性菌にのみ共通して保存されている遺伝子クラスターを明らかにした。本遺伝子クラスターにコードされる3-O-α-D-ガラクトシル-α-L-アラビノフラノシダーゼ(GAfase)はアラビアガムの側鎖末端から二糖を遊離する新規の反応性を持つ鍵酵素であった。さらにGAfase作用後に、α1,4-Arafの分解を行いα-L-アラビノフラノシダーゼとエキソ-β-1,3-ガラクターゼが協調的に作用していることを見出し、B.longumにおけるアラビアガム分解代謝機構の全容を明らかにした。(著者抄録)

  • 腸内細菌によるアラビノガラクタン-プロテインの糖鎖分解に関わる酵素群の役割

    藤田清貴, 佐々木優紀, 北原兼文

    バイオサイエンスとインダストリー   80 ( 6 )   2022年

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  • カラメルに含まれるオリゴ糖を分解する酵素の同定と構造基盤

    鹿島騰真, 石渡明弘, 藤田清貴, 伏信進矢

    生物物理(Web)   62 ( 3 )   2022年

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  • ラクトフェリンのAsn-糖鎖のプレバイオティックス作用とビフィズス菌の糖取り込みと代謝

    藤田清貴

    ラクトフェリン2021   37 - 42   2021年9月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

  • カラメル化糖に作用するビフィズス菌の新規exo-α-D-fructofuranosidaseの構造解析

    鹿島 騰真, 奥村 公喜, 荒川 孝俊, 山田 千早, 石渡 明弘, 伊藤 幸成, 藤田 清貴, 伏信 進矢

    応用糖質科学：日本応用糖質科学会誌   11 ( 2 )   105 - 106   2021年5月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：一般社団法人 日本応用糖質科学会  

    DOI： 10.5458/bag.11.2_105

  • バイオミディア　食物繊維が育む"大人"のビフィズス菌

    藤田 清貴

    生物工学会誌   97 ( 12 )   736 - 736   2019年12月

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    出版者・発行元：(公社)日本生物工学会  

  • Degradation of plant arabinogalactan proteins by intestinal bacteria: characteristics and functions of the enzymes involved. 査読

    Fujita, K., Sasaki, Y., and Kitahara, K.

    Appl. Microbiol. Biotech.   103   7451 - 7457   2019年

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    記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

  • ビフィズス菌が持つ糖タンパク質糖鎖の分解代謝システム：ビフィズス菌を増やすプレバイオティック糖タンパク質 査読

    藤田清貴

    化学と生物   55 ( 4 )   242 - 248   2017年3月

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    記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

  • 糖タンパク質糖鎖の加水分解酵素に関する研究 査読

    藤田清貴

    応用糖質科学   6 ( 1 )   30 - 36   2016年3月

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    記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）   出版者・発行元：応用糖質科学  

  • Functional analysis of degradative enzymes for hydroxyproline-linked β-L-arabinofuranosides in Bifidobacterium longum. 査読

    Fujita, K., Kitahara, K., and Suganuma, T.

    Trends Glycosci. Glycotechnol.   24 ( 139 )   215 - 224   2012年9月

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    記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

  • ビフィズス菌由来β-L-アラビノビオシダーゼの機能解析 査読

    藤田清貴、坂元志帆、小野祐樹、若尾雅広、隅田泰生、北原兼文、菅沼俊彦

    応用糖質科学   1 ( 2 )   153 - 158   2011年5月

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    記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

  • Functions of Novel Glycosidases Isolated from Bifidobacteria. 査読

    Katayama, T., Wada, J., Fujita, K., Kiyohara, M., Ashida, H., and Yamamoto, K.

    J. Appl. Glycosci.   55   101 - 109   2008年1月

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    記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

  • さつまいも食物繊維の糖分析と食品素材化-南九州の未利用糖質資源の活用-

    菅沼俊彦、北原兼文、藤田清貴

    FFI Journal   213   699 - 707   2008年

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    記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

  • Some distinguishable properties between acid-stable and neutral types of α-amylases from acid-producing koji. 査読

    Suganuma, T., Fujita, K., and Kitahara, K

    J. Biosci. Bioeng.   104 ( 5 )   353 - 362   2007年10月

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    記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

  • Novel bifidobacterial glycosidases acting on sugar chains of mucin glycoproteins.

    Katayama, T., Fujita, K., and Yamamoto, K.

    J. Biosci. Bioeng.   99   457 - 465   2005年1月

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    記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

  • 微生物酵素を用いた糖タンパク質糖鎖の自由なモデリング

    藤田清貴，山本憲二

    化学と生物   41   244 - 249   2003年

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    記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

  • 糸状菌の糖鎖工学・糖鎖生物学

    山本憲二，青木一弘，牧村 裕，藤田清貴

    日本農芸化学会誌   77   42 - 44   2003年

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    記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

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講演・口頭発表等

  • 藤田清貴 .  結核菌細胞壁を構成するD-アラビナンの分解に関わる酵素群の機能解析 .  第97回日本生化学会大会  2024年11月  招待

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    開催年月日： 2024年11月

    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

  • Kiyotaka Fujita .  Strategy of plant arabinogalactan-protein degradation by Bifidobacterium longum subsp. longum. .  The 1st International Symposium on Bifidobacterium Research  2024年10月  招待 国際会議

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    開催年月日： 2024年10月

    記述言語：英語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

  • 藤田清貴 .  腸内細菌におけるカラメル化糖の資化戦略 .  第13回応用糖質科学シンポジウム  2024年9月  招待

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    開催年月日： 2024年9月

    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

  • 藤田清貴 .  成人型ビフィズス菌における植物糖タンパク質の分解戦略 .  第96回日本生化学会大会  2023年11月  招待

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    開催年月日： 2023年11月

    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

  • Fujita, K., Morikami, S., Fukushima, R., Kitahara, K., Tanaka, K., Ito, Y., Fushinobu, S., and Ishiwata, A. .  A novel exo-β-D-arabinofuranosidase for the degradation of D-arabinan of Mycobacterial lipoarabinomannan .  26th International Symposium on Glycoconjugates (Glyco26)  2023年8月  国際会議

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    開催年月日： 2023年8月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

  • 藤田清貴 .  ビフィズス菌における難消化性糖質の分解代謝機構の解明. .  令和4 年度日本農芸化学会西日本支部例会  2022年6月  招待

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    開催年月日： 2022年6月

    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

  • Kiyotaka Fujita .  D-arabinan degradative enzymes of Microbacterium arabinogalactanolyticum for the assimilation of mycobacterial lipoarabinomannan. .  Microbial Glycoconjugates and the GlySpace Alliance (MiGGA) Symposium  2022年3月  国際会議

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    開催年月日： 2022年3月

    記述言語：英語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

  • 藤田清貴 .  結核菌細胞壁を構成するD-アラビナンの分解酵素群の発見. .  第18回糖鎖科学コンソーシアムシンポジウム  2021年12月  招待

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    開催年月日： 2021年12月

    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

  • 藤田清貴 .  未知の糖質分解酵素探索とビフィズス菌の生存戦略の解明. 酵素が拓くSDGs への道. .  JBA“未来へのバイオ技術” 勉強会  2021年10月  招待

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    開催年月日： 2021年10月

    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

  • 藤田清貴 .  成人型ビフィズス菌が持つ植物糖タンパク質糖鎖を資化するための分解酵素群. .  ビフィズス菌研究会第１回シンポジウム  2021年3月 

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    開催年月日： 2021年3月

    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

  • 藤田清貴 .  ラクトフェリンのAsn-糖鎖のプレバイオティックス作用とビフィズス菌の糖取り込みと代謝. .  日本ラクトフェリン学会第9回学術集会  招待

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    開催年月日： 2020年12月

    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

  • 佐々木 優紀、柳田真言、吉田圭祐、小田巻 俊孝、清水（肖） 金忠、北原 兼文、藤田清貴 .  アラビノガラクタンプロテインに対する成人型ビフィズス菌の二糖遊離酵素の機能解析. .  日本応用糖質科学会2020年度大会 

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    開催年月日： 2020年9月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

  • 鹿島騰真、奥村公喜、荒川孝俊、山田千早、石渡明弘、伊藤幸成、藤田清貴、伏信進矢 .  カラメル化糖に作用するビフィズス菌の新規exo-α-D-fructofuranosidaseの構造解析 .  日本応用糖質科学会2020年度大会  招待

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    開催年月日： 2020年9月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

  • 77. 佐々木 優紀、内村 祐美、堀米 綾子、小田巻 俊孝、清水（肖） 金忠、北原 兼文、藤田清貴 .  アラビアガム資化性を持つビフィズス菌由来のGH36 α-D-galactosidaseの機能解析. .  日本応用糖質科学会2019年度大会 

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    開催年月日： 2019年9月

    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

  • 藤田清貴, 田中悠暉, 石渡明弘, 伊藤幸成, 隅田泰生, 北原兼文 .  Microbacterium arabinogalactanolyticum由来の組み換えendo-D-arabinaseの機能解析. .  日本農芸化学会 2019年度大会 

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    開催年月日： 2019年3月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

  • 佐々木 優紀、堀米 綾子、小田巻 俊孝、清水（肖）金忠、北原 兼文、藤田清貴 .  ビフィズス菌由来アラビアガム分解酵素3-O-α-D-galactosyl-α-L-arabinofuranosidaseの機能解析. .  第25回日本生物工学会九州支部鹿児島大会 

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    開催年月日： 2018年12月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

  • 藤田清貴,石渡明弘,伊藤幸成,若尾雅広,隅田泰生,北原兼文 .  Aureobacterium sp. M2由来の組み換えendo-D-arabinaseの機能解析. .  第91回日本生化学会大会 

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    開催年月日： 2018年9月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

  • 佐々木 優紀、堀米 綾子、小田巻 俊孝、清水（肖） 金忠、北原 兼文、藤田清貴 .  アラビアガム資化性ビフィズス菌由来Gal-α1,3-Ara/Arap-β1,3-Ara分解酵素の機能解析. .  日本応用糖質科学会平成29年度大会 

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    開催年月日： 2018年9月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

  • 藤田清貴 .  ビフィズス菌が持つ植物糖タンパク質糖鎖の分解代謝システム. .  セルラーゼ研究会　第32回大会  招待

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    開催年月日： 2018年7月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

  • 佐々木 優紀、堀米 綾子、小田巻 俊孝、清水（肖） 金忠、北原 兼文、藤田清貴 .  Bifidobacterium longumにコードされたアラビアガム資化性の鍵を握る酵素の機能解析. .  2018年度 乳酸菌学会 

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    開催年月日： 2018年7月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

  • 佐々木 優紀、堀米 綾子、小田巻 俊孝、清水（肖） 金忠、北原 兼文、藤田清貴 .  ビフィズス菌のアラビアガム資化性の鍵を握る酵素endo-1,3-α-L-arabinofuranosidaseの機能解析 .  日本農芸化学会 2018年度大会 

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    開催年月日： 2018年3月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

  • 藤田清貴、嵩下 愛果、東郷 奈未、福元 諒、角町 華子、佐々木 優紀、北原 兼文 .  Bifidobacterium adolescentisのアラビノガラクタン-プロテイン分解酵素群をコードする遺伝子クラスターの解析 .  日本農芸化学会 2018年度大会 

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    開催年月日： 2018年3月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

  • 藤田清貴,石渡明弘,伊藤幸成,若尾雅広,隅田泰生,北原兼文 .  Lipoarabinomannanに作用する新規Ｄ－アラビナン分解酵素 .  第2回 抗酸菌研究会 

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    開催年月日： 2017年11月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

    開催地：国立感染症研究所戸山庁舎  

  • 藤田清貴 .  Bifidobacterium longum subsp. longumが持つ植物HRGP分解酵素群の役割. .  第８回グライコバイオロジクス研究会 

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    開催年月日： 2017年11月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

  • 佐々木優紀, 東郷奈未, 北原兼文, 藤田清貴 .  Bifidobacterium adolescentis由来の新規β-L-アラビノピラノシダーゼの機能解析 .  日本応用糖質科学会平成29年度大会 

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    開催年月日： 2017年9月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

  • 澤井未視, 下川倫子, 石渡明弘, 伊藤幸成, 若尾雅広, 隅田泰生, 北原兼文, 藤田清貴 .  Aureobacterium sp. M2由来endo-D-arabinaseの基質特異性の解析. .  日本応用糖質科学会平成29年度大会 

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    開催年月日： 2017年9月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

  • 藤田清貴 .  ビフィズス菌が持つ植物糖タンパク質糖鎖分解酵素の役割 .  第31回キチンキトサン学会大会  招待

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    開催年月日： 2017年8月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

  • 藤田清貴、石渡明弘、伊藤幸成、北原兼文 .  Bifidobacterium longum subsp. longum由来のβ-L-アラビノフラノシダーゼの機能解析 .  第36回日本糖質学会年会 

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    開催年月日： 2017年7月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

  • 藤田清貴、坂本 彩美、嵩下 愛果、東郷 奈未、北原兼文 .  Bifidobacterium longum subsp. longumのII型アラビノガラクタン分解酵素群の解析 .  日本農芸化学会 2017年度大会 

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    開催年月日： 2017年3月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

  • 藤田清貴、角町華子、石渡明弘、伊藤幸成、北原兼文 .  β-1,3-結合に作用するβ-L-アラビノフラノシダ―ゼの機能解析 .  日本応用糖質科学会平成28年度大会 

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    開催年月日： 2016年9月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

  • Fujita, K. .  Characterization of a β-1,3 specific β-L-arabinofuranosidases from subsp.Bifidobacterium longum subsp. longum .  International Carbohydrate Symposium 2016  国際会議

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    開催年月日： 2016年7月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

  • Fujita, K., Tsunomachi, H., Ishiwata, A., Ito, I., and Kitahara, K. .  Characterization of novel β-L-arabinofuranosidases acting on HRGPs. .  10th Georgia Glycoscience Symposium / Plant Polysaccharide Workshop 2016  国際会議

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    開催年月日： 2016年7月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

  • 藤田清貴、福元諒、北原兼文 .  Bifidobacterium adolescentis由来のGH27 β-L-アラビノピラノシダーゼ／α-D-ガラクトピラノシダーゼの機能解析. .  日本農芸化学会 2016年度大会  日本農芸化学会

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    開催年月日： 2016年3月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

    開催地：札幌  

  • Fujita, K., Tsunomachi, H., and Kitahara, K. .  The mechanism by which the plant HRGPs have prebiotic effect on Bifidobacterium longum. .  Food for Health International Conference (FOHIC2016)  国際会議

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    開催年月日： 2016年3月

    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

    開催地：Kagoshima, Japan  

  • 藤田清貴 .  ビフィズス菌由来の植物糖タンパク質糖鎖分解酵素群の機能解析. .  応用糖質九州支部 第18回特別講演会  日本応用糖質科学会九州支部

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    開催年月日： 2016年3月

    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

    開催地：鹿児島  

  • 58. 澤井未視、下川倫子、石渡明弘、伊藤幸成、若尾雅広、隅田泰生、北原兼文、藤田清貴 .  Aureobacterium sp. M2由来のエンド-D-アラビナーゼの精製と諸性質の解析 .  第67回日本生物工学会大会 

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    開催年月日： 2015年10月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

    開催地：鹿児島  

  • 藤田清貴 .  糖タンパク質糖鎖の加水分解酵素に関する研究 .  日本応用糖質科学会平成27年度大会  日本応用糖質科学会平成27年度大会

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    開催年月日： 2015年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：奈良  

    国内学会

  • 藤田清貴、亀山恭平、下川倫子、伏信進矢、石渡明弘、Sophon Kaeothip、伊藤幸成、北原兼文 .  βーアラビノオリゴ糖鎖に作用するβ-L-アラビノフラノシダーゼの機能解析 .  第34回日本糖質学会年会  第34回日本糖質学会年会

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    開催年月日： 2015年8月

    記述言語：日本語  

    開催地：東京  

    国内学会

  • 藤田清貴、坂本彩美、下川倫子、金子 哲、北原兼文 .  HRGPの分解に関与するBifidobacterium longum由来α-L-アラビノフラノシダーゼの機能解析 .  日本農芸化学会 2015年度大会  日本農芸化学会 2015年度大会

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    開催年月日： 2015年3月

    記述言語：日本語  

    開催地：岡山  

    国内学会

  • 坂本彩美、下川倫子、小竹敬久、円谷陽一、北原兼文、藤田清貴 .  Bifidobacterium longum由来のβ-1,6-ガラクタン側鎖分解酵素群の機能解析 .  日本応用糖質科学会平成26年度大会  日本応用糖質科学会平成26年度大会

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    開催年月日： 2014年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：新潟  

    国内学会

  • 藤田清貴、川原由義、下川倫子、伏信進矢、石渡明弘、Sophon Kaeothip、伊藤幸成、北原兼文 .  Bifidobacterium longumにコードされたβ-L-アラビノフラノシダーゼホモログの機能解析 .  日本応用糖質科学会平成26年度大会  日本応用糖質科学会平成26年度大会

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    開催年月日： 2014年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：新潟  

    国内学会

  • 藤田清貴、坂本彩美、下川倫子、北原兼文 .  Bifidobacterium longumのⅡ型アラビノガラクタン分解代謝経路の解析 .  第３3回日本糖質学会年会  第３3回日本糖質学会年会

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    開催年月日： 2014年8月

    記述言語：日本語  

    開催地：名古屋  

    国内学会

  • 伊藤 佑、齋川 匡、Seonah Kim、藤田 清貴、石渡 明弘、Sophon Kaeothip、荒川 孝俊、若木 高善、Gregg T. Beckham、伊藤 幸成、伏信 進矢 .  ビフィズス菌由来GH127 β-L-アラビノフラノシダ―ゼの新規な活性中心 .  日本農芸化学会 2014年度大会  日本農芸化学会 2014年度大会

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    開催年月日： 2014年3月

    記述言語：日本語  

    開催地：東京  

    国内学会

  • 藤田清貴、吉嶺良平、下川倫子、北原兼文 .  Bifidobacterium longumにおけるβ-アラビノオリゴ糖鎖分解酵素群の転写解析 .  日本農芸化学会 2014年度大会  日本農芸化学会 2014年度大会

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    開催年月日： 2014年3月

    記述言語：日本語  

    開催地：東京  

    国内学会

  • 坂本彩美、坂口武則、下川倫子、藤田清貴、北原兼文、菅沼俊彦 .  Bifidobacterium longum由来のエンド-β-1,6-ガラクタナーゼの機能解析 .  日本応用糖質科学会平成25年度大会  日本応用糖質科学会平成25年度大会

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    開催年月日： 2013年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：鹿児島  

    国内学会

  • 下川倫子、藤田清貴、北原兼文、菅沼俊彦 .  Bifidobacterium longum由来のβ-L-アラビノピラノシダーゼの機能解析 .  日本応用糖質科学会平成25年度大会  日本応用糖質科学会平成25年度大会

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    開催年月日： 2013年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：鹿児島  

    国内学会

  • 藤田清貴、坂本彩美、坂口武則、下川倫子、北原兼文 .  ビフィズス菌由来のⅡ型アラビノガラクタン分解酵素群の機能解析 .  第３２回日本糖質学会年会  第３２回日本糖質学会年会

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    開催年月日： 2013年8月

    記述言語：日本語  

    開催地：大阪  

    国内学会

  • 藤田清貴、坂口武則、北原兼文、菅沼俊彦 .  Bifidobacterium longum由来のエキソ-β-1,3-ガラクタナーゼの機能解析 .  日本農芸化学会 2013年度大会  日本農芸化学会 2013年度大会

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    開催年月日： 2013年3月

    記述言語：日本語  

    開催地：仙台  

    国内学会

  • 藤田清貴 .  ビフィズス菌が生産する植物糖タンパク質糖鎖分解酵素群の解析 .  第2回新潟大学国際糖質科学シンポジウム  第2回新潟大学国際糖質科学シンポジウム

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    開催年月日： 2012年11月

    記述言語：日本語  

    開催地：新潟  

    その他

  • 藤田清貴 .  ビフィズス菌が持つ植物糖タンパク質糖鎖分解酵素 .  第36回 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム  第36回 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム

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    開催年月日： 2012年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：宮崎  

    その他

  • 藤田清貴、奥山千代美、坂口武則、北原兼文、菅沼俊彦 .  Bifidobacterium longumのハイドロキシプロリンに富む糖タンパク質の分解メカニズムの解明 .  第16回腸内細菌腸内細菌学会  第16回腸内細菌腸内細菌学会

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    開催年月日： 2012年6月

    記述言語：日本語  

    開催地：兵庫  

    国内学会

  • 藤田清貴、奥山千代美、北原兼文、菅沼俊彦 .  β-アラビノオリゴ糖鎖のBifidobacterium longumに対する増殖促進効果 .  日本農芸化学会 2012年度大会  日本農芸化学会 2012年度大会

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    開催年月日： 2012年3月

    記述言語：日本語  

    開催地：京都  

    国内学会

  • 藤田清貴 .  ビフィズス菌が生産するβ-アラビノオリゴ糖鎖の分解酵素群の解析 .  日本農芸化学会西日本支部奨励賞講演会  日本農芸化学会西日本支部奨励賞講演会

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    開催年月日： 2012年1月

    記述言語：日本語  

    開催地：福岡  

    その他

  • 安川結野、中村正幸、藤田清貴、岩井 久 .  Xanthomonas campestris pv. campestris ATCC33913株由来β-L-アラビノフラノシダーゼのクローニングと機能解析 .  日本植物病理学会九州部会  日本植物病理学会九州部会

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    開催年月日： 2011年11月

    記述言語：日本語  

    開催地：大分  

    国内学会

  • 藤田清貴、五反田孝平、大渕衣里子、北原兼文、菅沼俊彦 .  ビフィズス菌由来β-L-アラビノフラノシダーゼのGlu366残基の役割 .  平成２３年度日本農芸化学会西日本支部・中四国支部合同大会  平成２３年度日本農芸化学会西日本支部・中四国支部合同大会

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    開催年月日： 2011年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：宮崎  

    国内学会

  • 藤田清貴、大渕衣里子、五反田孝平、北原兼文、菅沼俊彦 .  ビフィズス菌によるβ-アラビノオリゴ糖鎖の資化性と関連酵素群の解析 .  日本応用糖質科学会平成23年度大会  日本応用糖質科学会平成23年度大会

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    開催年月日： 2011年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：札幌  

    国内学会

  • Fujita, K., Sakamoto, S., Takashi, Y., Ono, Y., Obuchi, E., Kitahara, K., and Suganuma, T. .  Characterization of novel glycosidases involved in the degradation of Hyp-linked oligoarabinosides. .  9th Carbohydrate Bioengineering Meeting (CBM9)  9th Carbohydrate Bioengineering Meeting (CBM9)国際会議

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    開催年月日： 2011年5月

    記述言語：英語  

    開催地： Portugal  

    国際学会

  • 藤田清貴 .  ビフィズス菌によるβ-アラビノオリゴ糖鎖の分解と代謝 .  日本農芸化学会  日本農芸化学会

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    開催年月日： 2011年3月

    記述言語：日本語  

    開催地：京都  

    国内学会

  • 藤田清貴、坂元志帆、高 由香里、小野祐樹、大渕衣里子、北原兼文、菅沼俊彦 .  β-アラビノオリゴ糖鎖の分解に関わる新規糖質分解酵素群の機能解析 .  日本生物工学会2010年度大会  日本生物工学会2010年度大会

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    開催年月日： 2010年10月

    記述言語：日本語  

    開催地：宮崎  

    国内学会

  • 藤田清貴、高 由香里、大渕衣里子、北原兼文、菅沼俊彦 .  ビフィズス菌由来新規β-L-アラビノフラノシダーゼのクローニングと機能解析 .  日本応用糖質科学会平成22年度大会  日本応用糖質科学会平成22年度大会

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    開催年月日： 2010年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：静岡  

    国内学会

  • 藤田清貴、坂元志帆、高 由香里、小野祐樹、若尾雅広、隅田泰生、北原兼文、菅沼俊彦 .  ビフィズス菌由来β-L-アラビノビオシダーゼの機能解析 .  第17回糖質関連酵素化学シンポジウム  第17回糖質関連酵素化学シンポジウム

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    開催年月日： 2010年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：静岡  

    国内学会

  • 藤田清貴、坂元志帆、高 由香里、若尾雅広、隅田泰生、北原兼文、菅沼俊彦 .  β-アラビノオリゴ糖鎖の分解に関わる新規β-L-アラビノビオシダーゼの機能解析 .  日本農芸化学会  日本農芸化学会

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    開催年月日： 2010年3月

    記述言語：日本語  

    開催地：東京  

    国内学会

  • 坂元志帆、藤田清貴、若尾雅広、隅田泰生、北原兼文、菅沼俊彦 .  β-1,2-L-アラビノビオースを遊離させる新規糖質分解酵素の機能解析 .  日本応用糖質科学会  日本応用糖質科学会

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    開催年月日： 2009年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：青森  

    国内学会

  • 藤田清貴、坂元志帆、高 由香里、金子 哲、北原兼文、菅沼俊彦 .  ポテトレクチンの糖鎖部分に作用するGH43 α-L-arabinofuranosidaseの機能解析 .  日本応用糖質科学会  日本応用糖質科学会

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    開催年月日： 2009年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：青森  

    国内学会

  • 中本 政勝,藤田清貴,北原兼文,菅沼俊彦 .  部位特異的変異導入による焼酎白麹菌由来中性α-amylase Leu232の機能解析 .  日本応用糖質科学会  日本応用糖質科学会

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    開催年月日： 2008年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：沖縄  

    国内学会

  • 藤田清貴、坂元志帆、北原兼文、菅沼俊彦 .  Bifidobacterium longum由来の新規アラビナン分解酵素の機能解析 .  日本応用糖質科学会  日本応用糖質科学会

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    開催年月日： 2008年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：沖縄  

    国内学会

  • 藤田清貴 .  ペクチンのビフィズス菌に対するプレバイオティクス効果とグリコシダーゼの関係 .  第7回KAGAWA機能糖鎖フォーラム  第7回KAGAWA機能糖鎖フォーラム

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    開催年月日： 2008年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：香川  

    その他

  • 藤田清貴、北原兼文、菅沼俊彦、山本憲二、竹川薫 .  部位特異的変異導入によるendo-β-N-acetylglucosaminidase A(Endo-A)の糖転移効率の向上 .  日本糖質学会  日本糖質学会

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    開催年月日： 2008年8月

    記述言語：日本語  

    開催地：茨城  

    国内学会

  • 梅川碧里、藤田清貴、Wei Huang、Lai-Xi Wang、芦田久、山本憲二 .  Mucor hiemalis 由来 endo-β-N-acetylglucosaminidase (Endo-M)の糖転移機能の改変とその反応解析 .  日本応用糖質科学会 2007年度大会  日本応用糖質科学会 2007年度大会国際会議

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    開催年月日： 2007年8月

    記述言語：英語  

    開催地：神奈川  

    国際学会

  • 梅川碧里、藤田清貴、Wei Huang、加藤紀彦、芦田久、Lai-Xi Wang、山本憲二 .  Mucor hiemalis 由来 endo-β-N-acetylglucosaminidase (Endo-M) が有する特異な糖転移機能の改変及び解析 .  日本農芸化学会関西支部 第449回 講演会  日本農芸化学会関西支部 第449回 講演会

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    開催年月日： 2007年5月

    記述言語：日本語  

    開催地：京都  

    国内学会

  • 梅川碧里、藤田清貴、加藤紀彦、芦田久、山本憲二 .  Mucor hiemallis 由来 Endo-β-N-acetylglucosaminidase (Endo-M) の糖転移機能の改変 .  日本農芸化学会 2007 年度大会  日本農芸化学会 2007 年度大会

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    開催年月日： 2007年3月

    記述言語：日本語  

    開催地：東京  

    国内学会

  • 中本 政勝、藤田 清貴、北原 兼文、菅沼 俊彦 .  焼酎麹由来耐酸性α-アミラーゼの酵母での発現と機能解析 .  日本生物工学会九州支部大会（第13回）  日本生物工学会九州支部大会（第13回）

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    開催年月日： 2006年12月

    記述言語：日本語  

    開催地：鹿児島  

    国内学会

  • 梅川碧里、藤田清貴、加藤紀彦、芦田久、山本憲二 .  Mucor hiemalis由来エンド-β-N-アセチルグルコサミニダーゼ(Endo-M)の大腸菌における発現 .  日本応用糖質科学会平成 18 年度大会  日本応用糖質科学会平成 18 年度大会

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    開催年月日： 2006年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：大阪  

    国内学会

  • Fujita, K., Oura F., Nagamine N., Hiratake J., Ozawa H., Yamaguchi M., Katayama T., and Yamamoto K. .  Identification and Molecular Cloning of a Novel Endo-α- N-acetylgalactosaminidase from Bifidobacterium longum. .  20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress.  20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress.国際会議

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    開催年月日： 2006年6月

    記述言語：英語  

    開催地：京都  

    国際学会

  • 藤田 清貴、瀬口 智恵、北原 兼文、菅沼 俊彦 .  各種変異酵素を用いた焼酎麹耐酸性α-アミラーゼの機能解析 .  日本農芸化学会  日本農芸化学会

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    開催年月日： 2006年3月

    記述言語：日本語  

    開催地：京都  

    国内学会

  • 藤田 清貴、佐藤 玲子、戸澗 一孔、片山 高嶺、竹川 薫、山本 憲二 .  Chemical rescueを用いたendo-b-N-acetylglucosaminidase Aの触媒残基の同定. .  日本糖質学会年会  日本糖質学会年会

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    開催年月日： 2005年7月

    記述言語：日本語  

    開催地：大津  

    国内学会

  • 藤田 清貴、枇榔 誠、北原 兼文、菅沼 俊彦 .  焼酎麹α-アミラーゼのPichia pastorisでの発現と耐酸性の解析. .  日本農芸化学会  日本農芸化学会

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    開催年月日： 2005年3月

    記述言語：日本語  

    開催地：札幌  

    国内学会

  • 久保 留理子、藤田 清貴、北原 兼文、菅沼 俊彦 .  組換えペクチン分解酵素系を用いたサツマイモデンプン粕の分解様式 .  日本農芸化学会 2005年度大会  日本農芸化学会 2005年度大会

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    開催年月日： 2005年3月

    記述言語：日本語  

    開催地：北海道  

    国内学会

  • 鹿島 騰真, 奥村 公喜, 荒川 孝俊, 山田 千早, 石渡 明弘, 伊藤 幸成, 藤田 清貴, 伏信 進矢 .  カラメル化糖に作用するビフィズス菌の新規exo-α-D-fructofuranosidaseの構造解析 .  応用糖質科学  2020年11月  (一社)日本応用糖質科学会

  • 佐々木 優紀, 柳田 真言, 吉田 圭祐, 小田巻 俊孝, 清水 金忠[肖], 北原 兼文, 藤田 清貴 .  アラビノガラクタンプロテインに対する成人型ビフィズス菌の二糖遊離酵素の機能解析 .  応用糖質科学  2020年11月  (一社)日本応用糖質科学会

  • 澤野 孝太, 丸山 瞬, 荒川 孝俊, 中村 正幸, 石渡 明弘, 伊藤 幸成, 藤田 清貴, 伏信 進矢 .  Xanthomonas属細菌由来β-L-アラビノフラノシダーゼの結晶構造 .  生命科学系学会合同年次大会  2017年12月  生命科学系学会合同年次大会運営事務局

  • 佐々木 優紀, 堀米 綾子, 小田巻 俊孝, 清水 金忠[肖], 北原 兼文, 藤田 清貴 .  Bifidobacterium longumにコードされたアラビアガム資化性の鍵を握る酵素の機能解析 .  日本乳酸菌学会誌  2018年7月  日本乳酸菌学会

  • 藤田 清貴, 石渡 明弘, 伊藤 幸成, 若尾 雅広, 隅田 泰生, 北原 兼文 .  Aureobacterium sp.M2由来の組み換えendo-D-arabinaseの機能解析 .  日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2018年9月  (公社)日本生化学会

  • 藤田 清貴 .  糖鎖を介した微生物の生存戦略を探る　成人型ビフィズス菌における植物糖タンパク質の分解戦略 .  日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2023年10月  (公社)日本生化学会

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    記述言語：日本語  

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知的財産権

  • 糖質分解酵素、抗酸菌の検出キット及び抗酸菌の検出方法

    藤田 清貴

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    出願人：国立大学法人 鹿児島大学

    出願番号：特願2021-147456  出願日：2021年9月

    公開番号：特開2023-040472  公開日：2023年3月

    J-GLOBAL

  • 糖質分解酵素、食品添加用細菌のスクリーニング方法、プレバイオティクスの評価方法及びプライマー対

    藤田 清貴, 石渡 明弘

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    出願人：国立大学法人 鹿児島大学

    出願番号：特願2020-055336  出願日：2020年3月

    公開番号：特開2021-153433  公開日：2021年10月

    J-GLOBAL

  • 糖質分解酵素及びプレバイオティクスの評価方法

    藤田 清貴, 石渡 明弘

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    出願人：国立大学法人 鹿児島大学

    出願番号：特願2020-055336  出願日：2020年3月

    公開番号：特開2021-153433  公開日：2021年10月

    特許番号/登録番号：特許第7493751号  登録日：2024年5月 

    J-GLOBAL

  • 新規D−アラビナン分解酵素

    藤田 清貴, 隅田 泰生

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    出願人：株式会社スディックスバイオテック

    出願番号：特願2017-141706  出願日：2017年7月

    公開番号：特開2019-017358  公開日：2019年2月

    特許番号/登録番号：特許第7082262号  登録日：2022年5月  発行日：2022年6月

    J-GLOBAL

  • 新規アラビアガム資化性ビフィズス菌

    藤田 清貴, 小田巻 俊孝, 堀米 綾子

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    出願人：国立大学法人 鹿児島大学, 森永乳業株式会社

    出願番号：特願2017-138371  出願日：2017年7月

    公開番号：特開2019-017292  公開日：2019年2月

    特許番号/登録番号：特許第6972476号  登録日：2021年11月  発行日：2021年11月

    J-GLOBAL

受賞

  • 平成27年度日本応用糖質科学会奨励賞

    2015年9月   日本応用糖質科学会   糖タンパク質糖鎖の加水分解酵素に関する研究

    藤田 清貴

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    受賞国：日本国

  • 2012年度食創会 第17回 安藤百福賞 発明発見奨励賞

    2013年3月   安藤スポーツ・食文化振興財団   植物糖タンパク質糖鎖が有するビフィズス菌増殖促進効果の発見

    藤田 清貴

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    受賞国：日本国

  • 平成23年度日本農芸化学会西日本支部奨励賞（一般）

    2012年1月   日本農芸化学会西日本支部   ビフィズス菌が生産するβーアラビノオリゴ糖鎖の分解酵素群の解析

    藤田 清貴

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    受賞国：日本国

共同研究・競争的資金等の研究

  • 腸内細菌の分解メカニズムから解き明かすカラメル化糖のプレバイオティクス効果

    研究課題/領域番号：24K01704  2024年4月 - 2028年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    藤田 清貴, 伏信 進矢, 石渡 明弘

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    配分額：18590000円 （ 直接経費：14300000円 、 間接経費：4290000円 ）

  • 結核菌の細胞壁多糖に存在する鏡像体アラビナンとその分解酵素群の分子解析

    研究課題/領域番号：19H00929  2019年4月 - 2023年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(A)  基盤研究(A)

    伏信 進矢, 藤田 清貴, 石渡 明弘, 隅田 泰生, 新地 浩之

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    配分額：45240000円 （ 直接経費：34800000円 、 間接経費：10440000円 ）

  • 新規アラビノビオース遊離酵素により解き明かすビフィズス菌のAGP分解メカニズム

    2019年4月 - 2022年3月

    科学研究費補助金  基盤研究(C)

  • 微生物のシステイングリコシダーゼの構造機能解析と反応機構解明

    研究課題/領域番号：15H02443  2015年4月 - 2019年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(A)  基盤研究(A)

    伏信 進矢, 藤田 清貴, 石渡 明弘

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    配分額：42120000円 （ 直接経費：32400000円 、 間接経費：9720000円 ）

    我々はGH127およびGH146に分類されるβ-L-アラビノフラノシダーゼの結晶構造解析に成功し、その求核触媒が亜鉛に結合したCysであることを示した。これは糖質加水分解酵素では前例のない発見であったために、その反応機構についてはさらなる検証が必要である。本研究ではβ-L-アラビノフラノシド結合に作用する酵素の反応機構の詳細を明らかにするために、新規に開発する自殺基質や特異的阻害剤、反応中間体を模した擬似基質などを利用して構造機能解析を行った。
    植物病原菌由来の酵素XCCの構造解析の結果、当初の予想に反し、全く機能未知の新規な糖質結合ドメインとみられる存在が明らかになった。研究遂行上、このドメインの機能をみきわめることが不可欠であることから、まず新規ドメインの機能解析を行った後に、基質アナログ合成および布告剛体構造解析を行った。0.5 % アラビノキシラン（ビーチウッドキシラン）、0.5 % ガムアラビナン、0.5 % 脱分岐アラビナンを用いてアフィニティーゲル電気泳動を行った。このうち、脱分岐アラビナンに関しては、相同酵素であるBT0349での活性が確認されている。アフィニティーゲル電気泳動の結果、コントロールとして用いたウシ血清アルブミンと移動度の変化が見られなかったため、XCCの新規ドメインはこれらの多糖には結合しないことが明らかとなった。このことから、この新規ドメインが糖質結合能力ではなく、基質結合部位を覆うことによるsteric hindranceの効果で基質特異性に関与していることが推察された。

  • 植物糖タンパク質糖鎖分解酵素群の解析から明らかにするビフィズス菌間の共生関係

    2015年4月 - 2018年3月

    科学研究費補助金  基盤研究(C)

  • 植物糖タンパク質糖鎖分解酵素群の解析から明らかにするビフィズス菌間の共生関係

    研究課題/領域番号：15K07397  2015年4月 - 2018年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(C)  基盤研究(C)

    藤田 清貴

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    配分額：5070000円 （ 直接経費：3900000円 、 間接経費：1170000円 ）

    アラビナンやアラビノキシラン等の植物多糖及び、エクステンシンやアラビノガラクタン・プロテイン(AGP)等の植物糖タンパク質の末端の多くはL-アラビノース(L-Ara)で修飾されている。本研究では、B. adolescentis JCM1275のL-アラビノース分解酵素遺伝子クラスターにコードされたβ-L-アラビノピラノシダーゼ、α-L-アラビノフラノシダーゼ、β-L-アラビノフラノシダーゼの諸性質の機能解析に成功した。これらの酵素は共生関係にある他のビフィズス菌によって遊離された植物多糖及び糖タンパク質由来のオリゴ糖や二糖の分解代謝を担う酵素であると予想される。

  • 植物由来の新規な活性中心を持つグリコシダーゼの構造機能解析

    研究課題/領域番号：26660083  2014年4月 - 2018年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究  挑戦的萌芽研究

    伏信 進矢, 藤田 清貴, 石渡 明弘, 伊藤 幸成

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    配分額：3900000円 （ 直接経費：3000000円 、 間接経費：900000円 ）

    DUF1680に分類される植物由来の機能未知酵素の構造と機能を明らかにすることを当初の目的として研究を行った。シロイヌナズナとイネの遺伝子について異種発現を行い、多数の条件を試みたが、いずれも発現しないか不溶性でしか発現しなかった。新規ファミリーGH146に分類される植物病原菌（Xanthomonas属）由来のβ-L-アラビノフラノシダーゼについて立体構造を決定し、その活性中心がビフィズス菌由来のGH127酵素(HypBA1)と同様にシステインであることを明らかにした。さらに、本酵素が新規な糖質結合ドメインを有することがわかった。

  • ビフィズス菌のL-アラビノース含有オリゴ糖の分解に関わる菌体内酵素群の解析

    2013年4月 - 2017年3月

    その他機関  競争的研究資金 

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    資金種別：競争的資金

    ビフィズス菌のL-アラビノース含有オリゴ糖の分解に関わる菌体内酵素群の解析

  • ビフィズス菌のアラビノガラクタンープロテイン代謝機構に関わる糖質分解酵素群の解析

    2012年4月 - 2015年3月

    科学研究費補助金  基盤研究(C)

  • ビフィズス菌におけるL-アラビノースの輸送体と代謝酵素の同定

    2012年4月 - 2014年3月

    その他機関  競争的研究資金 

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    資金種別：競争的資金

    ビフィズス菌におけるL-アラビノースの輸送体と代謝酵素の同定

  • 大豆食品廃棄物のビフィズス菌増殖促進効果の検証

    2011年4月 - 2012年3月

    その他機関  競争的研究資金 

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    資金種別：競争的資金

    大豆食品廃棄物のビフィズス菌増殖促進効果の検証

  • ビフィズス菌のβーアラビノオリゴ糖鎖代謝機構に関わる糖質分解酵素群の解析

    2010年4月 - 2012年3月

    科学研究費補助金  若手研究(B)

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