MISC - 藤田　清貴

抗酸菌に特異的な糖脂質(LAM)の分解酵素 招待 査読

藤田清貴

月刊BIOINDUSTRY   24 ( 1 )   6 - 13   2025年1月

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記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）  

結核菌の細胞壁糖鎖を分解する新規酵素群の同定と構造基盤 招待

鹿島 騰真, 下川 倫子, 石渡 明弘, 藤田 清貴, 伏信 進矢

日本結晶学会誌   66 ( 3 )   171 - 172   2024年8月

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記述言語：日本語   出版者・発行元：日本結晶学会  

DOI： 10.5940/jcrsj.66.171

Role of β-L-Arabinofuranosidases in Intestinal Bacteria 招待 査読

Fujita K., Ishiwata A., Fushinobu S.

Trends in Glycoscience and Glycotechnology   36 ( 210 )   E35 - E38   2024年3月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）   出版者・発行元：FCCA(Forum: Carbohydrates Coming of Age)  

β-L-Arabinofuranosidase (β-Arafase) is an enzyme belonging to the glycoside hydrolase families GH127/137/142/146 that hydrolyze β-L-arabinofuranoside (Araf) from plant polysaccharides and glycoproteins. With the development of functional and structural analyses of β-Arafases from major human intestinal bacteria Bifidobacterium longum ssp. longum and Bacteroides thetaiotao-micron, the importance of β-Arafase to remove modified sugars has been revealed for the efficient degradation of dietary fibers by the intestinal bacteria. This minireview describes the distribution of β-Araf in plant polysaccharides and glycoproteins and the findings revealed by functional and structural studies of β-Arafases from intestinal bacteria.

DOI： 10.4052/tigg.2306.1e

Scopus

腸内細菌におけるβ-L-アラビノフラノシダーゼの役割 招待 査読

藤田 清貴, 石渡 明弘, 伏信 進矢

Trends in Glycoscience and Glycotechnology   36 ( 210 )   J35 - J38   2024年3月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）   出版者・発行元：FCCA(Forum: Carbohydrates Coming of Age)  

<p>糖加水分解酵素ファミリー127/137/142/146に属するβ-L-arabinofuranosidase（β-Ara<i>f</i>ase）は、植物多糖や植物糖タンパク質の修飾糖であるβ-L-アラビノフラノシド（Ara<i>f</i>）を分解する糖質加水分解酵素である。ヒトの主要な腸内細菌であるビフィズス菌<i>Bifidobacterium longum</i> ssp. <i>longum</i>やバクテロイデス属細菌<i>Bacteroides thetaiotaomicron</i>由来のβ-Ara<i>f</i>aseの機能解析と結晶構造解析の進展により、腸内細菌が食物繊維を効率良く分解するために、修飾糖の除去を担うβ-Ara<i>f</i>aseの重要性が明らかになってきた。本ミニレビューでは、植物多糖や植物糖タンパク質におけるβ-Ara<i>f</i>の分布と腸内細菌由来のβ-Ara<i>f</i>aseの機能・構造解析によって明らかにされた知見について解説する。</p>

DOI： 10.4052/tigg.2306.1j

DOI： 10.4052/tigg.2306.1J

Scopus

J-GLOBAL

Identification and structural basis of an enzyme that degrades oligosaccharides in caramel

Kashima T., Ishiwata A., Fujita K., Fushinobu S.

Biophysics and Physicobiology   20 ( 2 )   n/a   2023年

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記述言語：英語   出版者・発行元：一般社団法人 日本生物物理学会  

Cooking with fire produces foods containing carbohydrates that are not naturally occurring, such as α-D-fructofuranoside found in caramel. Each of the hundreds of compounds produced by caramelization reactions is considered to possess its own characteristics. Various studies from the viewpoints of biology and biochemistry have been conducted to elucidate some of the scientific characteristics. Here, we review the composition of caramelized sugars and then describe the enzymatic studies that have been conducted and the physiological functions of the caramelized sugar components that have been elucidated. In particular, we recently identified a glycoside hydrolase (GH), GH172 difructose dianhydride I synthase/hydrolase (αFFase1), from oral and intestinal bacteria, which is implicated in the degradation of oligosaccharides in caramel. The structural basis of αFFase1 and its ligands provided many insights. This discovery opened the door to several research fields, including the structural and phylogenetic relationship between the GH172 family enzymes and viral capsid proteins and the degradation of cell membrane glycans of acid-fast bacteria by some αFFase1 homologs. This review article is an extended version of the Japanese article, Identification and Structural Basis of an Enzyme Degrading Oligosaccharides in Caramel, published in SEIBUTSU BUTSURI Vol. 62, p. 184-186 (2022).

DOI： 10.2142/biophysico.bppb-v20.0017

Scopus

ビフィズス菌におけるアラビアガム分解代謝機構の解明

佐々木 優紀, 北原 兼文, 藤田 清貴

応用糖質科学   12 ( 2 )   108 - 116   2022年5月

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記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本応用糖質科学会  

アラビアガムは、マメ科アカシア属の木から得られる滲出物であり、ヒトの腸内でビフィズス菌を増殖させるプレバイオティクスとしての機能がある。分子構造の大部分はII型アラビノガラクタン鎖で構成されており、側鎖に多様な修飾糖が付加することで複雑な構造を有している。ビフィズス菌によるカラマツ由来のII型AGの分解機構が明らかになったものの、これらの酵素群はアラビアガムには作用せず、ビフィズス菌の増殖機構は不明であった。筆者らはB.longumのアラビアガム資化性が菌株特異的であることに着目し、資化性試験と比較ゲノム解析によって、資化性菌にのみ共通して保存されている遺伝子クラスターを明らかにした。本遺伝子クラスターにコードされる3-O-α-D-ガラクトシル-α-L-アラビノフラノシダーゼ(GAfase)はアラビアガムの側鎖末端から二糖を遊離する新規の反応性を持つ鍵酵素であった。さらにGAfase作用後に、α1,4-Arafの分解を行いα-L-アラビノフラノシダーゼとエキソ-β-1,3-ガラクターゼが協調的に作用していることを見出し、B.longumにおけるアラビアガム分解代謝機構の全容を明らかにした。(著者抄録)

腸内細菌によるアラビノガラクタン-プロテインの糖鎖分解に関わる酵素群の役割

藤田清貴, 佐々木優紀, 北原兼文

バイオサイエンスとインダストリー   80 ( 6 )   2022年

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J-GLOBAL

カラメルに含まれるオリゴ糖を分解する酵素の同定と構造基盤

鹿島騰真, 石渡明弘, 藤田清貴, 伏信進矢

生物物理(Web)   62 ( 3 )   2022年

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J-GLOBAL

ラクトフェリンのAsn-糖鎖のプレバイオティックス作用とビフィズス菌の糖取り込みと代謝

藤田清貴

ラクトフェリン2021   37 - 42   2021年9月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

カラメル化糖に作用するビフィズス菌の新規exo-α-D-fructofuranosidaseの構造解析

鹿島 騰真, 奥村 公喜, 荒川 孝俊, 山田 千早, 石渡 明弘, 伊藤 幸成, 藤田 清貴, 伏信 進矢

応用糖質科学：日本応用糖質科学会誌   11 ( 2 )   105 - 106   2021年5月

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記述言語：日本語   出版者・発行元：一般社団法人 日本応用糖質科学会  

DOI： 10.5458/bag.11.2_105

バイオミディア　食物繊維が育む"大人"のビフィズス菌

藤田 清貴

生物工学会誌   97 ( 12 )   736 - 736   2019年12月

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出版者・発行元：(公社)日本生物工学会  

Degradation of plant arabinogalactan proteins by intestinal bacteria: characteristics and functions of the enzymes involved. 査読

Fujita, K., Sasaki, Y., and Kitahara, K.

Appl. Microbiol. Biotech.   103   7451 - 7457   2019年

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記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

ビフィズス菌が持つ糖タンパク質糖鎖の分解代謝システム：ビフィズス菌を増やすプレバイオティック糖タンパク質 査読

藤田清貴

化学と生物   55 ( 4 )   242 - 248   2017年3月

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記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

糖タンパク質糖鎖の加水分解酵素に関する研究 査読

藤田清貴

応用糖質科学   6 ( 1 )   30 - 36   2016年3月

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記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）   出版者・発行元：応用糖質科学  

Functional analysis of degradative enzymes for hydroxyproline-linked β-L-arabinofuranosides in Bifidobacterium longum. 査読

Fujita, K., Kitahara, K., and Suganuma, T.

Trends Glycosci. Glycotechnol.   24 ( 139 )   215 - 224   2012年9月

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記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

ビフィズス菌由来β-L-アラビノビオシダーゼの機能解析 査読

藤田清貴、坂元志帆、小野祐樹、若尾雅広、隅田泰生、北原兼文、菅沼俊彦

応用糖質科学   1 ( 2 )   153 - 158   2011年5月

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記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

Functions of Novel Glycosidases Isolated from Bifidobacteria. 査読

Katayama, T., Wada, J., Fujita, K., Kiyohara, M., Ashida, H., and Yamamoto, K.

J. Appl. Glycosci.   55   101 - 109   2008年1月

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記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

さつまいも食物繊維の糖分析と食品素材化-南九州の未利用糖質資源の活用-

菅沼俊彦、北原兼文、藤田清貴

FFI Journal   213   699 - 707   2008年

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記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

Some distinguishable properties between acid-stable and neutral types of α-amylases from acid-producing koji. 査読

Suganuma, T., Fujita, K., and Kitahara, K

J. Biosci. Bioeng.   104 ( 5 )   353 - 362   2007年10月

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記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

Novel bifidobacterial glycosidases acting on sugar chains of mucin glycoproteins.

Katayama, T., Fujita, K., and Yamamoto, K.

J. Biosci. Bioeng.   99   457 - 465   2005年1月

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記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

微生物酵素を用いた糖タンパク質糖鎖の自由なモデリング

藤田清貴，山本憲二

化学と生物   41   244 - 249   2003年

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記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

糸状菌の糖鎖工学・糖鎖生物学

山本憲二，青木一弘，牧村 裕，藤田清貴

日本農芸化学会誌   77   42 - 44   2003年

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記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）